from configuration import CONFIG
from gestionOMS import *
from gestion_unites import *
-from gestion_donnees import calcule_max_graphique
+from gestion_donnees import calcule_max_graphique, convertit_jours_vers_python
import matplotlib.pyplot as plt
print(conf)
print(conf["non_sauve"])
if conf["non_sauve"].get("maxi",0) == 0:
- print("bla")
jour_maxi = calcule_max_graphique(l_jours)
else:
jour_maxi = conf["non_sauve"]["maxi"]+1
else:
unite = conf["non_sauve"]["unite"]
+ #debug("prématurité dans la config : "+conf["prematurite"],liste_err)
+ prema = int(convertit_jours_vers_python(conf["prematurite"],liste_err))
+ ## Gestion des prémas, deux cas :
+ # Si agecorrige est oui, alors on veut juste soustraire la valeur de préma
+ # à toutes les données.
+ # Si agecorrige est non, alors on veut ajouter la valeur de préma aux courbes de référence.
+
+ debug("Prématurité : "+str(prema)+" age corrigé : "+conf["agecorrige"],liste_err)
+
+ if prema>0 and conf["agecorrige"] == "oui":
+ l_jours = [j-prema for j in l_jours]
+ jour_maxi = jour_maxi - prema
+# debug("liste des jours : "+str(l_jours),liste_err)
+
l_jours_conv = convertit_tableau(l_jours,unite,liste_err)
# Attention, comme les jours commencent à partir de 0, faut enlever 1 pour avoir la borne...
age_maxi = convertitunite(jour_maxi-1,unite,liste_err)
- debug("cree_figure : conversion des unités ok",liste_err)
+ debug("cree_figure : conversion des unités ok : "+str(l_jours_conv),liste_err)
titre = "Courbe de "+typedonnee+" OMS"
else:
erreur("Type de courbe invalide"+conf["typecourbe"],liste_err)
return ""
-
- debug("cree_figure : géré le type de courbe ok. Liste des data labels : "+str(liste_data_labels),liste_err)
- debug("Fichier d'où extraire les données : "+fichier_oms,liste_err)
# Si y'a un nom on met "courbe de machin"
if conf["nom"] !="":
titre += " de " +conf["nom"]
+
+
+ if prema>0:
+ titre+= ", préma de "+conf["prematurite"]
+ if conf["agecorrige"] == "oui":
+ titre+=" (courbe en âge corrigé)"
+ else:
+ titre+=" (courbe en âge réel, données OMS décalées)"
+
+ debug("cree_figure : géré le type de courbe ok. Liste des data labels : "+str(liste_data_labels),liste_err)
+ debug("Fichier d'où extraire les données : "+fichier_oms,liste_err)
+
# convertir les unités
-
+ #### Partie code OMS
#### On extrait les données des courbes, et on convertit les jours dans l'unité voulues
try:
t = lire_fichier_csv(fichier_oms)
return ""
debug("cree_figure : on va convertir données OMS à la bonne unité",liste_err)
- try:
- coljour = convertit_tableau(extraire_colonne(t,0,jour_maxi),unite,liste_err)
+ try:
+ coljour= (extraire_colonne(t,0,jour_maxi))
+ if prema>0 and conf["agecorrige"] != "oui":
+ coljour = [j + prema for j in coljour]
+ coljour = convertit_tableau(coljour,unite,liste_err)
except:
erreur("Problème à la conversion du tableau OMS. jour_maxi = "+str(jour_maxi)+" unite = "+unite,liste_err)
return ""
debug("cree_figure : prête à créer la figure",liste_err)
- #### La figure
+ #### La figure, params
+
fig = plt.figure(num=None, figsize=(conf["largeur"], conf["hauteur"]), dpi=100, facecolor=conf["couleurs"]["fond"])
plt.rcParams['axes.facecolor'] = conf["couleurs"]["fond"]
plt.rcParams['axes.edgecolor']= conf["couleurs"]["cadretxt"]
plt.rcParams['grid.color'] = conf["couleurs"]["grille"]
plt.rcParams['legend.edgecolor'] = conf["couleurs"]["grille"]
- #warning("bla"+str(liste_data_labels),liste_err)
+ #Tracé des courbes OMS
for (i,label,couleur) in liste_data_labels:
plt.plot(coljour,extraire_colonne(t,i,jour_maxi),label=label,color=couleur)
#warning("colonne"+str(i)+str(label)+str(couleur),liste_err)
debug("cree_figure : tracé des courbes OMS ok",liste_err)
+
+ ##### Tracé des courbes OMS fini
+
# On extrait la valeur min et la valeur max des poids
(colonne_min,_,_) = liste_data_labels[-1]
(colonne_max,_,_) = liste_data_labels[0]
poids_min = max(0,poids_min-1)
#max : +5%
poids_max = poids_max * 1.05
+
- #warning("Jusque là ça marche",liste_err)
debug("cree_figure : prête à tracer la courbe de l'enfant",liste_err)
-
+
+ ### Tracé pour de bon
if l_jours != []:
plt.plot(l_jours_conv,l_poids,label=conf["nom"],color=conf["couleurs"]["cadretxt"],marker='o')
-
+ debug("Tracé de la courbe enfant, avec les jours "+str(l_jours_conv),liste_err)
+
+ #### extrapolatios éventuelles
+ #print("prolongercourbes" in conf)
+ if conf["prolongercourbes"] == "oui":
+ #print("coucou")
+ # les dates, on prend tous les jours tant qu'à faire
+ date_fin = int(l_jours[-1])
+ dates_extrapole = list(range(date_fin, jour_maxi))
+ donnees_extrapole = prolongecourbe(t, date_fin, l_poids[-1], dates_extrapole, conf["typecourbe"], liste_err)
+ #print("données extrapolées !")
+ dates_extrapole = convertit_tableau(dates_extrapole,unite,liste_err)
+
+ # tracé des données extrapolées
+ plt.plot(dates_extrapole, donnees_extrapole,color=conf["couleurs"]["cadretxt"], linestyle=(0, (5,7)), marker=None)
+
+ else:
+ debug("On ne trace pas de courbe enfant", liste_err)
+
plt.xlabel("Âge en "+unite,color=conf["couleurs"]["cadretxt"])
plt.ylabel(typedonnee.capitalize()+" en "+CONFIG["unites_typedonnees"][typedonnee],color=conf["couleurs"]["cadretxt"])
+ #print("bla")
plt.title(titre,color=conf["couleurs"]["cadretxt"])
- plt.axis([0,age_maxi,poids_min,poids_max])
+ #print("ble")
+ if l_jours_conv == []:
+ plt.axis([0,age_maxi, poids_min, poids_max])
+ else:
+ plt.axis([min(0,l_jours_conv[0]),age_maxi,poids_min,poids_max])
+ #print("bli")
+
if conf['legende']=="oui":
legende = plt.legend(loc=conf['positionlegende'])
fig.tight_layout()
- #warning("Jusque là ça marche",liste_err)
- return fig
\ No newline at end of file
+ debug("Fin de cree_figure", liste_err)
+ return fig
+
+
+
+def prolongecourbe(tableauOMS, date, donnee, nouvdates, typecourbe, liste_err):
+ """ tableauOMS est le ableau des données OMS. date et donnee sont la date (jours)
+ et la dernière donnée d'où on extrapole. On veut les extrapolations à nouvdate
+ (tableaux de jours)
+ typecourbe est P ou Z. Pour P il faut commencer à regarder à l'indice 4, pour Z
+ à l'indice 1
+ On renvoie [] si pas pu extrapoler. """
+
+ # la ligne OMS
+ ligneoms = tableauOMS[date]
+ debug("prolongecourbe : Ligne OMS :"+str(ligneoms)+" valeur de donnée : "+str(donnee), liste_err)
+
+
+ # On cherche dans quel intervalle on se situe
+ if typecourbe == "P":
+ idep=4
+ else:
+ idep = 1
+ i = idep
+ while i<len(ligneoms) and ligneoms[i]<donnee:
+ i+=1
+ debug("prolongecourbe : on a trouvé la valeur de i : "+str(i),liste_err)
+ if i>=len(ligneoms):
+ warning("prolongation de courbe : pas réussi... donnée au dessus !", liste_err)
+ return []
+ if i==idep:
+ warning("prolongation de courbe : pas réussi... donnée en dessous !", liste_err)
+ return []
+
+ # Le coeff : donnee = coeff * l[i-1]+ (1-coeff)*ligne[i]
+ # On utilisera la même chose pour la nouvelle donnee
+ #print(ligneoms[i], ligneoms[i-1])
+ coeff = (donnee - ligneoms[i])/(ligneoms[i-1] - ligneoms[i])
+ #print("coeff : "+str(coeff))
+
+ # extrapolations
+ nouvdonnees = []
+ for j in nouvdates:
+ ligne2 = tableauOMS[j]
+ nouvdonnees.append(coeff*ligne2[i-1]+ (1-coeff)*ligne2[i])
+
+ return nouvdonnees
\ No newline at end of file