X-Git-Url: https://git.immae.eu/?p=perso%2FDenise%2Foms.git;a=blobdiff_plain;f=trace_courbe.py;h=fab64718c0f7508795f13fea2854b268e5b3d19e;hp=a967916f70ad92496aaa7a230366b15526386fed;hb=c2fe511bb9e6974cc267b8926a47b1fa81b37da3;hpb=8b5845ffdbffa3cf291bfef8e224c1d81bdd09de diff --git a/trace_courbe.py b/trace_courbe.py index a967916..fab6471 100644 --- a/trace_courbe.py +++ b/trace_courbe.py @@ -3,7 +3,7 @@ from configuration import CONFIG from gestionOMS import * from gestion_unites import * -from gestion_donnees import calcule_max_graphique +from gestion_donnees import calcule_max_graphique, convertit_jours_vers_python import matplotlib.pyplot as plt @@ -24,7 +24,6 @@ def cree_figure(conf,l_jours,l_poids,typedonnee,liste_err): print(conf) print(conf["non_sauve"]) if conf["non_sauve"].get("maxi",0) == 0: - print("bla") jour_maxi = calcule_max_graphique(l_jours) else: jour_maxi = conf["non_sauve"]["maxi"]+1 @@ -45,11 +44,25 @@ def cree_figure(conf,l_jours,l_poids,typedonnee,liste_err): else: unite = conf["non_sauve"]["unite"] + #debug("prématurité dans la config : "+conf["prematurite"],liste_err) + prema = int(convertit_jours_vers_python(conf["prematurite"],liste_err)) + ## Gestion des prémas, deux cas : + # Si agecorrige est oui, alors on veut juste soustraire la valeur de préma + # à toutes les données. + # Si agecorrige est non, alors on veut ajouter la valeur de préma aux courbes de référence. + + debug("Prématurité : "+str(prema)+" age corrigé : "+conf["agecorrige"],liste_err) + + if prema>0 and conf["agecorrige"] == "oui": + l_jours = [j-prema for j in l_jours] + jour_maxi = jour_maxi - prema +# debug("liste des jours : "+str(l_jours),liste_err) + l_jours_conv = convertit_tableau(l_jours,unite,liste_err) # Attention, comme les jours commencent à partir de 0, faut enlever 1 pour avoir la borne... age_maxi = convertitunite(jour_maxi-1,unite,liste_err) - debug("cree_figure : conversion des unités ok",liste_err) + debug("cree_figure : conversion des unités ok : "+str(l_jours_conv),liste_err) titre = "Courbe de "+typedonnee+" OMS" @@ -79,17 +92,26 @@ def cree_figure(conf,l_jours,l_poids,typedonnee,liste_err): else: erreur("Type de courbe invalide"+conf["typecourbe"],liste_err) return "" - - debug("cree_figure : géré le type de courbe ok. Liste des data labels : "+str(liste_data_labels),liste_err) - debug("Fichier d'où extraire les données : "+fichier_oms,liste_err) # Si y'a un nom on met "courbe de machin" if conf["nom"] !="": titre += " de " +conf["nom"] + + + if prema>0: + titre+= ", préma de "+conf["prematurite"] + if conf["agecorrige"] == "oui": + titre+=" (courbe en âge corrigé)" + else: + titre+=" (courbe en âge réel, données OMS décalées)" + + debug("cree_figure : géré le type de courbe ok. Liste des data labels : "+str(liste_data_labels),liste_err) + debug("Fichier d'où extraire les données : "+fichier_oms,liste_err) + # convertir les unités - + #### Partie code OMS #### On extrait les données des courbes, et on convertit les jours dans l'unité voulues try: t = lire_fichier_csv(fichier_oms) @@ -98,14 +120,18 @@ def cree_figure(conf,l_jours,l_poids,typedonnee,liste_err): return "" debug("cree_figure : on va convertir données OMS à la bonne unité",liste_err) - try: - coljour = convertit_tableau(extraire_colonne(t,0,jour_maxi),unite,liste_err) + try: + coljour= (extraire_colonne(t,0,jour_maxi)) + if prema>0 and conf["agecorrige"] != "oui": + coljour = [j + prema for j in coljour] + coljour = convertit_tableau(coljour,unite,liste_err) except: erreur("Problème à la conversion du tableau OMS. jour_maxi = "+str(jour_maxi)+" unite = "+unite,liste_err) return "" debug("cree_figure : prête à créer la figure",liste_err) - #### La figure + #### La figure, params + fig = plt.figure(num=None, figsize=(conf["largeur"], conf["hauteur"]), dpi=100, facecolor=conf["couleurs"]["fond"]) plt.rcParams['axes.facecolor'] = conf["couleurs"]["fond"] plt.rcParams['axes.edgecolor']= conf["couleurs"]["cadretxt"] @@ -114,13 +140,16 @@ def cree_figure(conf,l_jours,l_poids,typedonnee,liste_err): plt.rcParams['grid.color'] = conf["couleurs"]["grille"] plt.rcParams['legend.edgecolor'] = conf["couleurs"]["grille"] - #warning("bla"+str(liste_data_labels),liste_err) + #Tracé des courbes OMS for (i,label,couleur) in liste_data_labels: plt.plot(coljour,extraire_colonne(t,i,jour_maxi),label=label,color=couleur) #warning("colonne"+str(i)+str(label)+str(couleur),liste_err) debug("cree_figure : tracé des courbes OMS ok",liste_err) + + ##### Tracé des courbes OMS fini + # On extrait la valeur min et la valeur max des poids (colonne_min,_,_) = liste_data_labels[-1] (colonne_max,_,_) = liste_data_labels[0] @@ -137,17 +166,43 @@ def cree_figure(conf,l_jours,l_poids,typedonnee,liste_err): poids_min = max(0,poids_min-1) #max : +5% poids_max = poids_max * 1.05 + - #warning("Jusque là ça marche",liste_err) debug("cree_figure : prête à tracer la courbe de l'enfant",liste_err) - + + ### Tracé pour de bon if l_jours != []: plt.plot(l_jours_conv,l_poids,label=conf["nom"],color=conf["couleurs"]["cadretxt"],marker='o') - + debug("Tracé de la courbe enfant, avec les jours "+str(l_jours_conv),liste_err) + + #### extrapolatios éventuelles + #print("prolongercourbes" in conf) + if conf["prolongercourbes"] == "oui": + #print("coucou") + # les dates, on prend tous les jours tant qu'à faire + date_fin = int(l_jours[-1]) + dates_extrapole = list(range(date_fin, jour_maxi)) + donnees_extrapole = prolongecourbe(t, date_fin, l_poids[-1], dates_extrapole, conf["typecourbe"], liste_err) + #print("données extrapolées !") + dates_extrapole = convertit_tableau(dates_extrapole,unite,liste_err) + + # tracé des données extrapolées + plt.plot(dates_extrapole, donnees_extrapole,color=conf["couleurs"]["cadretxt"], linestyle=(0, (5,7)), marker=None) + + else: + debug("On ne trace pas de courbe enfant", liste_err) + plt.xlabel("Âge en "+unite,color=conf["couleurs"]["cadretxt"]) plt.ylabel(typedonnee.capitalize()+" en "+CONFIG["unites_typedonnees"][typedonnee],color=conf["couleurs"]["cadretxt"]) + #print("bla") plt.title(titre,color=conf["couleurs"]["cadretxt"]) - plt.axis([0,age_maxi,poids_min,poids_max]) + #print("ble") + if l_jours_conv == []: + plt.axis([0,age_maxi, poids_min, poids_max]) + else: + plt.axis([min(0,l_jours_conv[0]),age_maxi,poids_min,poids_max]) + #print("bli") + if conf['legende']=="oui": legende = plt.legend(loc=conf['positionlegende']) @@ -156,5 +211,50 @@ def cree_figure(conf,l_jours,l_poids,typedonnee,liste_err): fig.tight_layout() - #warning("Jusque là ça marche",liste_err) - return fig \ No newline at end of file + debug("Fin de cree_figure", liste_err) + return fig + + + +def prolongecourbe(tableauOMS, date, donnee, nouvdates, typecourbe, liste_err): + """ tableauOMS est le ableau des données OMS. date et donnee sont la date (jours) + et la dernière donnée d'où on extrapole. On veut les extrapolations à nouvdate + (tableaux de jours) + typecourbe est P ou Z. Pour P il faut commencer à regarder à l'indice 4, pour Z + à l'indice 1 + On renvoie [] si pas pu extrapoler. """ + + # la ligne OMS + ligneoms = tableauOMS[date] + debug("prolongecourbe : Ligne OMS :"+str(ligneoms)+" valeur de donnée : "+str(donnee), liste_err) + + + # On cherche dans quel intervalle on se situe + if typecourbe == "P": + idep=4 + else: + idep = 1 + i = idep + while i=len(ligneoms): + warning("prolongation de courbe : pas réussi... donnée au dessus !", liste_err) + return [] + if i==idep: + warning("prolongation de courbe : pas réussi... donnée en dessous !", liste_err) + return [] + + # Le coeff : donnee = coeff * l[i-1]+ (1-coeff)*ligne[i] + # On utilisera la même chose pour la nouvelle donnee + #print(ligneoms[i], ligneoms[i-1]) + coeff = (donnee - ligneoms[i])/(ligneoms[i-1] - ligneoms[i]) + #print("coeff : "+str(coeff)) + + # extrapolations + nouvdonnees = [] + for j in nouvdates: + ligne2 = tableauOMS[j] + nouvdonnees.append(coeff*ligne2[i-1]+ (1-coeff)*ligne2[i]) + + return nouvdonnees \ No newline at end of file