#!/usr/bin/env python3
# -*- coding: utf-8 -*-
-from configuration import *
-from gestionOMS import *
-from gestion_unites import *
+from configuration import CONFIG
+import gestionOMS as oms
+import gestion_unites as u
+from gestion_donnees import calcule_max_graphique, convertit_jours_vers_python
+from gestion_erreurs import debug, erreur, warning
+from numpy import arange
import matplotlib.pyplot as plt
-def cree_figure(conf,l_jours,l_poids,liste_err):
- #warning("debut de cree_figure"+str(conf),liste_err)
+# Essentiellement, la fonction qui trace la courbe
+
+
+def cree_figure(conf,l_jours,l_poids,typedonnee,liste_err):
+ """ conf est le dictionnaire de config. l_jours et l_poids les listes des temps (en jours) et de données
+ (donc pas forcément du poids)
+ typedonnee est le type de données (voir CONFIG["liste_typedonnees"]
+ liste_err la liste des erreurs à compléter (voir gestion_erreurs))
+ Renvoie la figure tracée"""
+ debug("debut de cree_figure. Config : "+str(conf),liste_err)
try:
- liste_data_labels_p,liste_data_labels_z = renvoie_liste_labels(conf,liste_data_choisie_p,liste_data_choisie_z,liste_err)
+ liste_data_labels_p,liste_data_labels_z = oms.renvoie_liste_labels(conf,CONFIG["liste_data_choisie_p"],CONFIG["liste_data_choisie_z"],liste_err)
except:
erreur("bug avec liste data labels",liste_err)
return ""
- #warning("bla",liste_err)
+ ######################## Gestion des bornes #############################
+ # y a-t-il un maxi saisi par l'utilisateur ?
if conf["maxi"] ==0:
- if l_jours != []:
- jour_maxi = max(l_jours)# pas la peine d'aller très au delà du jour max
- jour_maxi = int(jour_maxi* 1.1)+3 # on rajoute un peu
+ # Est-ce qu'on a donné un maxi quand même (car même échelle) ?
+ if conf["non_sauve"].get("maxi",0) == 0:
+ jour_maxi = calcule_max_graphique(l_jours)
else:
- jour_maxi = int(6*jours_dans_mois) # si pas de données, arbitrairement on met ça
+ jour_maxi = conf["non_sauve"]["maxi"]+1
else:
jour_maxi = conf["maxi"]+1
+
+ # On s'assure que c'est bien compris dans les bornes
+ jour_maxi = max(CONFIG["jours_mini_courbe"],min(jour_maxi,CONFIG["jours_maxi_courbe"]))
+ debug("cree_figure : gestion du jour max : "+str(jour_maxi),liste_err)
- jour_maxi = min(jour_maxi,jours_maxi_courbe)
+ ##################### Gestion des unités ###############################
+ # si l'unité n'est pas précisée, ni en "non sauvé" ni par l'utilisateur
+ if conf["unite"] == "" and conf["non_sauve"].get("unite","") == "":
+ unite = u.choix_unite(jour_maxi)
+ debug("Unité non précisée, on choisit "+unite,liste_err)
+ elif conf["unite"] != "":
+ unite = conf["unite"]
+ else:
+ unite = conf["non_sauve"]["unite"]
- if conf["unite"] == "":
- conf["unite"] = choix_unite(jour_maxi)
-
- l_jours_conv = convertit_tableau(l_jours,conf["unite"],liste_err)
+ ##################### Gestion de la prématurité #######################"
+ prema = int(convertit_jours_vers_python(conf["prematurite"],liste_err))
+ ## Gestion des prémas, deux cas :
+ # Si agecorrige est oui, alors on veut juste soustraire la valeur de préma
+ # à toutes les données.
+ # Si agecorrige est non, alors on veut ajouter la valeur de préma aux courbes de référence.
+ debug("Prématurité : "+str(prema)+" age corrigé : "+conf["agecorrige"],liste_err)
+ if prema>0 and conf["agecorrige"] == "oui":
+ l_jours = [j-prema for j in l_jours]
+ jour_maxi = jour_maxi - prema
+
+
+ ###################### Conversion des unités ###########################""
+ l_jours_conv = u.convertit_tableau(l_jours,unite,liste_err)
# Attention, comme les jours commencent à partir de 0, faut enlever 1 pour avoir la borne...
- age_maxi = convertitunite(jour_maxi-1,conf["unite"],liste_err)
+ age_maxi = u.convertitunite(jour_maxi-1,unite,liste_err)
+ debug("cree_figure : conversion des unités ok : "+str(l_jours_conv),liste_err)
- titre = "Courbe de poids OMS"
-
-# warning("cree_figure : ça va jusque là ",liste_err)
- #warning("bli"+str(conf),liste_err)
- #warninf("coucou")
-
+ #####################" Courbes OMS et titre ######################################"
+ titre = "Courbe de "+typedonnee+" OMS"
if conf["typecourbe"] == "P":
# percentiles
liste_data_labels = liste_data_labels_p
if conf["sexe"] == "M":
- fichier_oms = f_poids_perc_garcon
+ fichier_oms = CONFIG["fichiersOMS"][typedonnee]["perc_garcon"]#f_poids_perc_garcon
titre += " (percentiles, garçon)"
elif conf["sexe"] == "F":
- fichier_oms = f_poids_perc_fille
+ fichier_oms = CONFIG["fichiersOMS"][typedonnee]["perc_fille"]
titre += " (percentiles, fille)"
else:
- fichier_oms = f_poids_perc_mixte
+ fichier_oms = CONFIG["fichiersOMS"][typedonnee]["perc_mixte"]
titre += " (percentiles)"
elif conf["typecourbe"] == "Z":
liste_data_labels = liste_data_labels_z
- if conf["sexe"] == "G":
- fichier_oms = f_poids_z_garcon
+ if conf["sexe"] == "M":
+ fichier_oms = CONFIG["fichiersOMS"][typedonnee]["z_garcon"]
titre += " (moyenne et écarts-types, garçon)"
elif conf["sexe"] == "F":
- fichier_oms = f_poids_z_fille
+ fichier_oms = CONFIG["fichiersOMS"][typedonnee]["z_fille"]
titre += " (moyenne et écarts-types, fille)"
else:
- fichier_oms = f_poids_z_mixte
+ fichier_oms = CONFIG["fichiersOMS"][typedonnee]["z_mixte"]
titre += " (moyenne et écarts-types)"
else:
- warning("Type de courbe invalide"+conf["typecourbe"],liste_err)
-
-# warning("cree_figure : ça va jusque là ",liste_err)
-# warning("bli"+str(conf),liste_err)
-
-
+ erreur("Type de courbe invalide"+conf["typecourbe"],liste_err)
+ return ""
+
# Si y'a un nom on met "courbe de machin"
if conf["nom"] !="":
titre += " de " +conf["nom"]
-
-
- # convertir les unités
+
+ if prema>0:
+ titre+= ", préma de "+conf["prematurite"]
+ if conf["agecorrige"] == "oui":
+ titre+=" (courbe en âge corrigé)"
+ else:
+ titre+=" (courbe en âge réel, données OMS décalées)"
+
+ #debug("cree_figure : géré le type de courbe ok. Liste des data labels : "+str(liste_data_labels),liste_err)
+ debug("Fichier d'où extraire les données : "+fichier_oms,liste_err)
+
#### On extrait les données des courbes, et on convertit les jours dans l'unité voulues
try:
- t = lire_fichier_csv(fichier_oms)
+ t = oms.lire_fichier_csv(fichier_oms)
except:
- liste_err[0].append("Impossible d'ouvrir le fichier "+fichier_oms)
- coljour = convertit_tableau(extraire_colonne(t,0,jour_maxi),conf["unite"],liste_err)
+ erreur("cree_figure : Impossible d'ouvrir le fichier "+fichier_oms, liste_err)
+ return ""
+
+ debug("cree_figure : Conversion des données OMS à la bonne unité",liste_err)
+ try:
+ coljour= (oms.extraire_colonne(t,0,jour_maxi))
+ if prema>0 and conf["agecorrige"] != "oui":
+ coljour = [j + prema for j in coljour]
+ coljour = u.convertit_tableau(coljour,unite,liste_err)
+ except:
+ erreur("Problème à la conversion du tableau OMS. jour_maxi = "+str(jour_maxi)+" unite = "+unite,liste_err)
+ return ""
+
+ ##################### Création de la figure et du graphique ###################
+ debug("cree_figure : prête à créer la figure",liste_err)
+ #### La figure, params
-
- #### La figure
fig = plt.figure(num=None, figsize=(conf["largeur"], conf["hauteur"]), dpi=100, facecolor=conf["couleurs"]["fond"])
plt.rcParams['axes.facecolor'] = conf["couleurs"]["fond"]
plt.rcParams['axes.edgecolor']= conf["couleurs"]["cadretxt"]
plt.rcParams['ytick.color'] = conf["couleurs"]["cadretxt"]
plt.rcParams['grid.color'] = conf["couleurs"]["grille"]
plt.rcParams['legend.edgecolor'] = conf["couleurs"]["grille"]
+ ax = plt.axes()
- #warning("bla"+str(liste_data_labels),liste_err)
+ ###################### Tracé des différentes courbes
+ #Tracé des courbes OMS
for (i,label,couleur) in liste_data_labels:
- plt.plot(coljour,extraire_colonne(t,i,jour_maxi),label=label,color=couleur)
- #warning("colonne"+str(i)+str(label)+str(couleur),liste_err)
+ ax.plot(coljour,oms.extraire_colonne(t,i,jour_maxi),label=label,color=couleur)
+
+ debug("cree_figure : tracé des courbes OMS ok",liste_err)
+
+ ### Tracé pour de bon
+ if l_jours != []:
+ ax.plot(l_jours_conv,l_poids,label=conf["nom"],color=conf["couleurs"]["cadretxt"],marker='o')
+ debug("Tracé de la courbe enfant, avec les jours "+str(l_jours_conv),liste_err)
+
+ #### extrapolatios éventuelles
+ #print("prolongercourbes" in conf)
+ if conf["prolongercourbes"] == "oui":
+ #print("coucou")
+ # les dates, on prend tous les jours tant qu'à faire
+ date_fin = int(l_jours[-1])
+ dates_extrapole = list(range(date_fin, jour_maxi))
+ donnees_extrapole = prolongecourbe(t, date_fin, l_poids[-1], dates_extrapole, conf["typecourbe"], liste_err)
+ #print("données extrapolées !")
+ dates_extrapole = u.convertit_tableau(dates_extrapole,unite,liste_err)
+
+ # tracé des données extrapolées
+ plt.plot(dates_extrapole, donnees_extrapole,color=conf["couleurs"]["cadretxt"], linestyle=(0, (5,7)), marker=None)
+ debug("Tracé de la courbe extrapolée ok", liste_err)
+
+ else:
+ debug("On ne trace pas de courbe enfant", liste_err)
+ ###################" Gestion de l'échelle #####################
+ debug("Courbes tracées. Il n'y a plus qu'à gérer l'échelle", liste_err)
+ ### échelle à régler
-
- # On extrait la valeur min et la valeur max des poids
+ # On extrait la valeur min et la valeur max des poids des courbes OMS et des données
(colonne_min,_,_) = liste_data_labels[-1]
(colonne_max,_,_) = liste_data_labels[0]
- poids_min = min(extraire_colonne(t,colonne_min,jour_maxi))
- poids_max = max(extraire_colonne(t,colonne_max,jour_maxi))
+ # poids max OMS
+ poids_min = min(oms.extraire_colonne(t,colonne_min,jour_maxi))
+ poids_max = max(oms.extraire_colonne(t,colonne_max,jour_maxi))
if l_jours != []:
poids_min = min(min(l_poids),poids_min)
- poids_max = max(max(l_poids),poids_max)
+ # Pour le poids max, voir la dernière valeur du tableau
+ i = 0
+ while i<len(l_jours) and l_jours[i]<jour_maxi:
+ i=i+1
+ poids_max = max(max(l_poids[0:i+1]),poids_max)
# On ajuste un peu ces min et max
# min : valeur min -1kg
poids_min = max(0,poids_min-1)
#max : +5%
poids_max = poids_max * 1.05
+
+
+ # Grille custom ?
+ if conf["non_sauve"]["grilleamelio"] == "oui":
+ debug("On a choisi la grille plus jolie", liste_err)
+ pas=u.choix_echelle_data(typedonnee, poids_max)
+ # data_min_arrondie
+ minechelle = int(poids_min/pas[0])*pas[0]
- #warning("Jusque là ça marche",liste_err)
+ debug("pas choisis pour l'échelle en y : "+str(pas), liste_err)
+ echellemajeure = arange(minechelle, poids_max, pas[0])
+
+ if pas[1] >0:
+ echellemineure = arange(minechelle, poids_max, pas[1])
+ else:
+ echellemineure = []
+
+ ax.set_yticks(echellemajeure, minor=False)
+ ax.set_yticks(echellemineure, minor=True)
- if l_jours != []:
- plt.plot(l_jours_conv,l_poids,label=conf["nom"],color=conf["couleur_cadretxt"],marker='o')
+ # échelle en temps
+ pas=u.choix_echelle_temps(unite, age_maxi)
+ debug("pas choisis pour l'échelle en x : "+str(pas), liste_err)
- plt.xlabel("Âge en "+conf["unite"],color=conf["couleurs"]["cadretxt"])
- plt.ylabel("Poids en kg",color=conf["couleurs"]["cadretxt"])
+ echellemajeure = arange(0,age_maxi, pas[0])
+ if pas[1] >0:
+ echellemineure = arange(0,age_maxi, pas[1])
+ else:
+ echellemineure = []
+ ax.set_xticks(echellemajeure, minor=False)
+ ax.set_xticks(echellemineure, minor=True)
+
+ ################################# Aspect du graphique
+
+ debug("On commende la déco du graphique", liste_err)
+
+ # La grille
+ ax.grid(conf["grille"]=="oui")
+ ax.grid(conf["grille"] == "oui", which="minor", linestyle="--")
+
+
+ plt.xlabel("Âge en "+unite,color=conf["couleurs"]["cadretxt"])
+ plt.ylabel(typedonnee.capitalize()+" en "+CONFIG["unites_typedonnees"][typedonnee],color=conf["couleurs"]["cadretxt"])
+ #print("bla")
plt.title(titre,color=conf["couleurs"]["cadretxt"])
- plt.axis([0,age_maxi,poids_min,poids_max])
+ #print("ble")
+ if l_jours_conv == []:
+ plt.axis([0,age_maxi, poids_min, poids_max])
+ else:
+ plt.axis([min(0,l_jours_conv[0]),age_maxi,poids_min,poids_max])
+ #print("bli")
+
if conf['legende']=="oui":
legende = plt.legend(loc=conf['positionlegende'])
plt.setp(legende.get_texts(), color=conf["couleurs"]["cadretxt"])
- plt.grid(conf["grille"]=="oui")
+
fig.tight_layout()
- #warning("Jusque là ça marche",liste_err)
- return fig
\ No newline at end of file
+ debug("Fin de cree_figure, tout va bien.", liste_err)
+ return fig
+
+
+
+
+######################################## Pour extrapoler la courbe
+
+def prolongecourbe(tableauOMS, date, donnee, nouvdates, typecourbe, liste_err):
+ """ tableauOMS est le ableau des données OMS. date et donnee sont la date (jours)
+ et la dernière donnée d'où on extrapole. On veut les extrapolations à nouvdate
+ (tableaux de jours)
+ typecourbe est P ou Z. Pour P il faut commencer à regarder à l'indice 4, pour Z
+ à l'indice 1
+ On renvoie [] si pas pu extrapoler. """
+
+ # la ligne OMS
+ ligneoms = tableauOMS[date]
+ debug("prolongecourbe : Ligne OMS :"+str(ligneoms)+" valeur de donnée : "+str(donnee), liste_err)
+
+
+ # On cherche dans quel intervalle on se situe
+ if typecourbe == "P":
+ idep=4
+ else:
+ idep = 1
+ i = idep
+ while i<len(ligneoms) and ligneoms[i]<donnee:
+ i+=1
+ debug("prolongecourbe : on a trouvé la valeur de i : "+str(i),liste_err)
+ if i>=len(ligneoms):
+ warning("prolongation de courbe : pas réussi... donnée trop haute !", liste_err)
+ return []
+ if i==idep:
+ warning("prolongation de courbe : pas réussi... donnée trop basse !", liste_err)
+ return []
+
+ # Le coeff : donnee = coeff * l[i-1]+ (1-coeff)*ligne[i]
+ # On utilisera la même chose pour la nouvelle donnee
+ coeff = (donnee - ligneoms[i])/(ligneoms[i-1] - ligneoms[i])
+
+ # extrapolations
+ nouvdonnees = []
+ for j in nouvdates:
+ ligne2 = tableauOMS[j]
+ nouvdonnees.append(coeff*ligne2[i-1]+ (1-coeff)*ligne2[i])
+
+ return nouvdonnees
\ No newline at end of file
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