import gestion_unites as u
from gestion_donnees import calcule_max_graphique, convertit_jours_vers_python
from gestion_erreurs import debug, erreur, warning
+from calculs_extrapole import calcule_donnee_extrapolee, calcule_age_extrapole, interpole_lineaire, interpole_lineaire_ordonnee, formate_resultat_donnee, formate_resultat_age, formate_interpole, formate_extrapole
+
from numpy import arange
+
import matplotlib.pyplot as plt
-# Essentiellement, la fonction qui trace la courbe
+# Essentiellement, la fonction qui trace la courbe, mais on y trouve également les fonctions d'extrapolation.
+# Ainsi que les calculs additionnels.
-def cree_figure(conf,l_jours,l_poids,typedonnee,liste_err):
+def cree_figure(conf,l_jours,l_poids,typedonnee,liste_extracalculs, liste_err, enfants_add = []):
""" conf est le dictionnaire de config. l_jours et l_poids les listes des temps (en jours) et de données
(donc pas forcément du poids)
typedonnee est le type de données (voir CONFIG["liste_typedonnees"]
liste_err la liste des erreurs à compléter (voir gestion_erreurs))
- Renvoie la figure tracée"""
- debug("debut de cree_figure. Config : "+str(conf),liste_err)
+ Renvoie la figure tracée, et les calculs additionnels sont mis sous forme de chaîne dans la liste
+ liste_extracalculs
+
+ Les enfants en plus sont dans la liste enfants_add. Pour chaque item de la liste, il faut prendre
+ item[typed] pour avoir accès au nom, ljours, et ldonnees
+
+ """
+ debug("debut de cree_figure. Config : "+str(conf)+". Nombre d'enfants additionnels : "+str(len(enfants_add)),liste_err)
try:
liste_data_labels_p,liste_data_labels_z = oms.renvoie_liste_labels(conf,CONFIG["liste_data_choisie_p"],CONFIG["liste_data_choisie_z"],liste_err)
except:
jour_maxi = conf["non_sauve"]["maxi"]+1
else:
jour_maxi = conf["maxi"]+1
+
+ # Si on cherche à extrapoler au-delà
+ if conf["non_sauve"]["calculextradata_type"] == typedonnee and conf["non_sauve"]["calculextradata_age"]>jour_maxi:
+ jour_maxi = int(conf["non_sauve"]["calculextradata_age"]) +1
# On s'assure que c'est bien compris dans les bornes
jour_maxi = max(CONFIG["jours_mini_courbe"],min(jour_maxi,CONFIG["jours_maxi_courbe"]))
erreur("Type de courbe invalide"+conf["typecourbe"],liste_err)
return ""
- # Si y'a un nom on met "courbe de machin"
- if conf["nom"] !="":
- titre += " de " +conf["nom"]
-
- if prema>0:
- titre+= ", préma de "+conf["prematurite"]
- if conf["agecorrige"] == "oui":
- titre+=" (courbe en âge corrigé)"
- else:
- titre+=" (courbe en âge réel, données OMS décalées)"
+ ## On finira le titre plus tard quand on aura su qui est concerné
#debug("cree_figure : géré le type de courbe ok. Liste des data labels : "+str(liste_data_labels),liste_err)
debug("Fichier d'où extraire les données : "+fichier_oms,liste_err)
### Tracé pour de bon
if l_jours != []:
- ax.plot(l_jours_conv,l_poids,label=conf["nom"],color=conf["couleurs"]["cadretxt"],marker='o')
+ print(conf["symbole"])
+ ax.plot(l_jours_conv,l_poids,label=conf["nom"],color=conf["couleurs"]["courbeenfant"],marker=conf["symbole"])
debug("Tracé de la courbe enfant, avec les jours "+str(l_jours_conv),liste_err)
+
+
+ listenoms = []
+ if conf["nom"] != "": # Ajouter le nom de l'enfant
+ listenoms.append(conf["nom"])
+
+# if enfants_add != []:
+# debug("Il y a des enfants en plus à tracer. Données : "+str(enfants_add), liste_err)
+ for enfant in enfants_add: # Enfants additionnels éventuels
+ conf_add, lj, ld = enfant[typedonnee] # On récuère les données
+ if lj != []: # pas la peine de tracer si y'a rien à tracer
+ # Ajouter le nom de cet enfant-là
+ listenoms.append(conf_add["nom"])
+ lj_conv = u.convertit_tableau(lj,unite,liste_err)
+ debug("Tracé de la courbe additionnelle de "+conf_add["nom"]+" config : "+str(conf_add), liste_err)
+ ax.plot(lj_conv, ld, label=conf_add["nom"], color=conf_add["couleurcourbe"],marker=conf_add["symbole"])
+
+ if conf["sexe"] != conf_add["sexe"]:
+ warning("Attention, tous les enfants n'ont pas le même sexe. La courbe de référence est celle de "+conf["nom"]+" et ne sera pas forcément pertinente pour les autres. Vous pouvez éventuellement essayer la courbe neutre. Remarque : cette alerte s'affichera quand même.", liste_err)
+
+
+ # Si y'a un nom on met "courbe de machin"
+ if listenoms != []:
+ titre += " de " +", ".join(listenoms)
+
+ if prema>0:
+ titre+= ", préma de "+conf["prematurite"]
+ if conf["agecorrige"] == "oui":
+ titre+=" (courbe en âge corrigé)"
+ else:
+ titre+=" (courbe en âge réel, données OMS décalées)"
#### extrapolatios éventuelles
- #print("prolongercourbes" in conf)
- if conf["prolongercourbes"] == "oui":
- #print("coucou")
- # les dates, on prend tous les jours tant qu'à faire
- date_fin = int(l_jours[-1])
- dates_extrapole = list(range(date_fin, jour_maxi))
- donnees_extrapole = prolongecourbe(t, date_fin, l_poids[-1], dates_extrapole, conf["typecourbe"], liste_err)
- #print("données extrapolées !")
- dates_extrapole = u.convertit_tableau(dates_extrapole,unite,liste_err)
-
- # tracé des données extrapolées
- plt.plot(dates_extrapole, donnees_extrapole,color=conf["couleurs"]["cadretxt"], linestyle=(0, (5,7)), marker=None)
- debug("Tracé de la courbe extrapolée ok", liste_err)
+ # a-t-on demndé des calculs ?
+ jextrapole = conf["non_sauve"]["prolongercourbes"] == "oui"
+ # Est-ce qu'on a demandé un calcul sur cette donnée ?
+
+ for calextra in CONFIG["extradata"]:
+ jextrapole = jextrapole or conf["non_sauve"][calextra+"_type"] == typedonnee
+
+ #print(jextrapole)
+ ############################## Là où on extrapole ################################
+ if jextrapole:
+ try:
+ debug("Il faut extrapoler les courbes !", liste_err)
+ # Prendre l'ensemble des dates "source"
+ # print(conf["non_sauve"]["nbdataextra"])
+ if conf["non_sauve"]["nbextradata"] == 0:
+ sources_extrap = l_jours
+ sources_extrap_data = l_poids
+ else:
+ sources_extrap = l_jours[-conf["non_sauve"]["nbextradata"]:] # les derniers jours
+ sources_extrap_data = l_poids[-conf["non_sauve"]["nbextradata"]:]
+
+ debug("On extrapole sur les jours : "+str(sources_extrap), liste_err)
+
+ # On récupère toutes les données extrapolées
+ dates_extrapole, donnees_extrapole = prolongecourbe(t, sources_extrap, sources_extrap_data, conf["typecourbe"], liste_err)
+ debug("données extrapolées !", liste_err)
+ #debug(str(dates_extrapole[0:10])+str(donnees_extrapole[0:10]), liste_err)
+
+ # QUe veut-on maintenant sur ces données extrapolées ?
+ # Afficher la courbe
+ if conf["non_sauve"]["prolongercourbes"] == "oui":
+ # On va prendre les extrapolations de la dernière donnée jusqu'à l fin du graphe
+ debut_extr = int(l_jours[-conf["non_sauve"]["nbextradata"]])
+ i_debut_extr = dates_extrapole.index(debut_extr)
+ i_fin_extr = dates_extrapole.index(jour_maxi)
+ # Voilà ce qu'on veut tracer
+ dates_extrapole_trace = dates_extrapole[i_debut_extr:i_fin_extr+1]
+ donnees_extrapole_trace = donnees_extrapole[i_debut_extr:i_fin_extr+1]
+ dates_extrapole_trace = u.convertit_tableau(dates_extrapole_trace,unite,liste_err)
+
+ # tracé des données extrapolées
+ plt.plot(dates_extrapole_trace, donnees_extrapole_trace,color=conf["couleurs"]["cadretxt"], linestyle=(0, (5,7)), marker=None)
+ debug("Tracé de la courbe extrapolée ok", liste_err)
+
+ ### Calculer une donnée à l'âge x
+ if conf["non_sauve"]["calculextradata_type"] == typedonnee:
+ # On essaie l'interpolation
+ r = interpole_lineaire(l_jours,l_poids,conf["non_sauve"]["calculextradata_age"], liste_err)
+ if r==-1:
+ # ça sera donc une extrapolation
+ r = calcule_donnee_extrapolee(dates_extrapole, donnees_extrapole, conf["non_sauve"]["calculextradata_age"], liste_err)
+ message=formate_extrapole(conf["non_sauve"]["nbextradata"])
+ else:
+ message=formate_interpole()
+
+ texte = formate_resultat_donnee(conf["non_sauve"]["calculextradata_age"], r, typedonnee, message, liste_err)
+ debug("calcul de la donnée extrapolée : "+texte, liste_err)
+ if texte!="":
+ liste_extracalculs.append(texte)
+ print(liste_extracalculs)
+ # Ajouter le trait ?
+ if conf["non_sauve"]["calculextradata_trace"] == "oui":
+ dessine_guides(conf["non_sauve"]["calculextradata_age"], r, conf["couleurs"]["cadretxt"], unite, ax, liste_err)
+
+ ### Calculer un âge où on atteint cette donnée
+ if conf["non_sauve"]["calculextratemps_type"] == typedonnee:
+ # interpolation
+ r = interpole_lineaire_ordonnee(l_jours,l_poids,conf["non_sauve"]["calculextratemps_val"], liste_err)
+ if r==-1:
+ # ça sera donc une extrapolation
+ r = calcule_age_extrapole(dates_extrapole, donnees_extrapole, conf["non_sauve"]["calculextratemps_val"], liste_err)
+ message=formate_extrapole(conf["non_sauve"]["nbextradata"])
+ else:
+ message=formate_interpole()
+
+ texte = formate_resultat_age(r, conf["non_sauve"]["calculextratemps_val"], typedonnee, message, liste_err)
+
+ #r = calcule_age_extrapole(dates_extrapole, donnees_extrapole, conf["non_sauve"]["calculextratemps_val"], typedonnee, liste_err)
+ if texte!="":
+ liste_extracalculs.append(texte)
+ print(liste_extracalculs)
+ # Ajouter le trait ?
+ if conf["non_sauve"]["calculextratemps_trace"]:
+ dessine_guides(r, conf["non_sauve"]["calculextratemps_val"], conf["couleurs"]["cadretxt"], unite, ax, liste_err)
+
+ except:
+ warning("Des problèmes pour extrapoler...", liste_err)
else:
debug("On ne trace pas de courbe enfant", liste_err)
poids_max = poids_max * 1.05
+ ### Repères additionnels éventuels.
+ #reperes est une liste qui contient des dictionnaires avec "typed" (type de donnée : âge, etc), "donnee" :
+ #la donnée (en jours pour l'âge), et "texte": le texte à mettre sur le repère en question.
+ #Pour tracer des repères verticaux (horizontaux plus tard) sur la courbe.
+ for rep in conf["liste_reperes"]:
+ if rep.get("trace", "") == "oui": # SI on veut tracer
+ agec = u.convertitunite(rep["donnee"], unite, liste_err)
+ # Tracé de la ligne verticale
+ ax.vlines(agec, poids_min, poids_max, linestyles="dashed", color=conf["couleurs"]["cadretxt"])
+ # Tracé éventuel du texte
+ if rep["texte"] != "":
+ ax.text(agec, poids_min, " "+rep["texte"], rotation=90, verticalalignment='bottom', horizontalalignment='right', color=conf["couleurs"]["cadretxt"])
+
+
+
+
+
# Grille custom ?
if conf["non_sauve"]["grilleamelio"] == "oui":
debug("On a choisi la grille plus jolie", liste_err)
plt.xlabel("Âge en "+unite,color=conf["couleurs"]["cadretxt"])
plt.ylabel(typedonnee.capitalize()+" en "+CONFIG["unites_typedonnees"][typedonnee],color=conf["couleurs"]["cadretxt"])
- #print("bla")
plt.title(titre,color=conf["couleurs"]["cadretxt"])
- #print("ble")
if l_jours_conv == []:
plt.axis([0,age_maxi, poids_min, poids_max])
else:
plt.axis([min(0,l_jours_conv[0]),age_maxi,poids_min,poids_max])
- #print("bli")
if conf['legende']=="oui":
######################################## Pour extrapoler la courbe
-def prolongecourbe(tableauOMS, date, donnee, nouvdates, typecourbe, liste_err):
- """ tableauOMS est le ableau des données OMS. date et donnee sont la date (jours)
- et la dernière donnée d'où on extrapole. On veut les extrapolations à nouvdate
+def prolongecourbe(tableauOMS, dates, donnees, typecourbe, liste_err):
+ """ tableauOMS est le ableau des données OMS. dates et donnees sont les dates (jours)
+ et les données d'où on extrapole. On calcule toutes les dates comme des sauvages.
+ On renvoie la liste des jours totale et la liste des data_totales
(tableaux de jours)
typecourbe est P ou Z. Pour P il faut commencer à regarder à l'indice 4, pour Z
à l'indice 1
- On renvoie [] si pas pu extrapoler. """
+ On renvoie [],[] si pas pu extrapoler. """
+ # les lignes OMS correspondant aux dates données
+ lignesoms = [tableauOMS[int(date)] for date in dates]
+ debug("prolongecourbe : Lignes OMS :"+str(lignesoms)+" valeur de données : "+str(donnees), liste_err)
- # la ligne OMS
- ligneoms = tableauOMS[date]
- debug("prolongecourbe : Ligne OMS :"+str(ligneoms)+" valeur de donnée : "+str(donnee), liste_err)
- # On cherche dans quel intervalle on se situe
+ # Principe : on cherche dans quel intervalle de "colonnes" on se situe.
+ # On va donc regarder pour chaque donnée entre quels i on se situe,et après
+ # prendre le plus grand intervalle.
+ # Numéros de colonnes d'où on part. Pour la fin c'est forcément longueur-1
if typecourbe == "P":
idep=4
else:
idep = 1
- i = idep
- while i<len(ligneoms) and ligneoms[i]<donnee:
- i+=1
- debug("prolongecourbe : on a trouvé la valeur de i : "+str(i),liste_err)
- if i>=len(ligneoms):
- warning("prolongation de courbe : pas réussi... donnée trop haute !", liste_err)
- return []
- if i==idep:
- warning("prolongation de courbe : pas réussi... donnée trop basse !", liste_err)
- return []
+
+ liste_indices = []
+ for k in range(len(dates)):
+ i= idep
+ ligne = lignesoms[k]
+ while i<len(ligne) and ligne[i]<donnees[k]:
+ i+=1
+ debug("prolongecourbe : on a trouvé la valeur de i : "+str(i),liste_err)
+ if i>=len(ligne):
+ warning("prolongation de courbe : pas réussi... donnée trop haute !", liste_err)
+ return [],[]
+ if i==idep:
+ warning("prolongation de courbe : pas réussi... donnée trop basse !", liste_err)
+ return [],[]
+ liste_indices.append(i)
+ imin=min(liste_indices) -1
+ imax=max(liste_indices)
+ debug("Les données se situent dans les indices : "+str(imin)+", "+str(imax),liste_err)
+ # Maintenant on doit trouver les coeffs : on se situe en coeff * l[imin]+ (1-coeff)*ligne[imax]
+ # Et faire la moyenne de ces coeffs
+ total = 0
+ for k in range(len(dates)):
+ ligne = lignesoms[k]
+ donnee = donnees[k]
+ total += (donnee - ligne[imax])/(ligne[imin] - ligne[imax])
+ #print(k)
+ coeff_moyen = total/len(dates)
+
+ debug("Coeff moyen calculé : "+str(coeff_moyen), liste_err)
- # Le coeff : donnee = coeff * l[i-1]+ (1-coeff)*ligne[i]
- # On utilisera la même chose pour la nouvelle donnee
- coeff = (donnee - ligneoms[i])/(ligneoms[i-1] - ligneoms[i])
+ # On utilisera la même chose pour les nouvelle donnee
# extrapolations
+ nouvdates =oms.extraire_colonne(tableauOMS,0) # On sort tout.
+ #print(nouvdates)
nouvdonnees = []
for j in nouvdates:
- ligne2 = tableauOMS[j]
- nouvdonnees.append(coeff*ligne2[i-1]+ (1-coeff)*ligne2[i])
+ ligne2 = tableauOMS[int(j)]
+ nouvdonnees.append(coeff_moyen*ligne2[imin]+ (1-coeff_moyen)*ligne2[imax])
+
+ return nouvdates,nouvdonnees
+
- return nouvdonnees
\ No newline at end of file
+def dessine_guides(t, data, couleur, unite, ax, liste_err):
+ """ dessine deux lignes, horizontales et verticales qui vont "vers" la courbe
+ jusqu'aux points (t, data). En pointillés et avec un point dessus."""
+ debug("Début de dessine_guides"+str(t)+", "+str(data), liste_err)
+ t_conv = u.convertitunite(t,unite,liste_err)
+ ax.vlines(t_conv, 0, data, colors=couleur, linestyles="dashed")
+ ax.hlines(data, 0, t_conv, color=couleur, linestyles="dashed")
+ ax.plot([t_conv], [data], color=couleur, marker="*", ms=13)
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