#!/usr/bin/env python3
# -*- coding: utf-8 -*-
-from configuration import *
+from configuration import CONFIG
from gestionOMS import *
from gestion_unites import *
+from gestion_donnees import calcule_max_graphique, convertit_jours_vers_python
import matplotlib.pyplot as plt
-def cree_figure(conf,l_jours,l_poids,liste_err):
- #warning("debut de cree_figure"+str(conf),liste_err)
+# Essentiellement, la fonction qui trace la courbe
+
+
+def cree_figure(conf,l_jours,l_poids,typedonnee,liste_err):
+ debug("debut de cree_figure",liste_err)
try:
- liste_data_labels_p,liste_data_labels_z = renvoie_liste_labels(conf,liste_data_choisie_p,liste_data_choisie_z,liste_err)
+ liste_data_labels_p,liste_data_labels_z = renvoie_liste_labels(conf,CONFIG["liste_data_choisie_p"],CONFIG["liste_data_choisie_z"],liste_err)
except:
erreur("bug avec liste data labels",liste_err)
return ""
- #warning("bla",liste_err)
+ # maxi saisi par l'utilisateur ?
if conf["maxi"] ==0:
- if l_jours != []:
- jour_maxi = max(l_jours)# pas la peine d'aller très au delà du jour max
- jour_maxi = int(jour_maxi* 1.1)+3 # on rajoute un peu
+ # Est-ce qu'on a donné un maxi quand même (car même échelle) ?
+ print(conf)
+ print(conf["non_sauve"])
+ if conf["non_sauve"].get("maxi",0) == 0:
+ jour_maxi = calcule_max_graphique(l_jours)
else:
- jour_maxi = int(6*jours_dans_mois) # si pas de données, arbitrairement on met ça
+ jour_maxi = conf["non_sauve"]["maxi"]+1
else:
jour_maxi = conf["maxi"]+1
+
+
+ # On s'assure que c'est bien compris dans les bornes
+ jour_maxi = max(CONFIG["jours_mini_courbe"],min(jour_maxi,CONFIG["jours_maxi_courbe"]))
+ debug("cree_figure : gestion du jour max ok : "+str(jour_maxi),liste_err)
- jour_maxi = min(jour_maxi,jours_maxi_courbe)
+ # si l'unité n'est pas précisée, ni en "non sauvé" ni par l'utilisateur
+ if conf["unite"] == "" and conf["non_sauve"].get("unite","") == "":
+ unite = choix_unite(jour_maxi)
+ debug("Unité non précisée, on choisit "+unite,liste_err)
+ elif conf["unite"] != "":
+ unite = conf["unite"]
+ else:
+ unite = conf["non_sauve"]["unite"]
- if conf["unite"] == "":
- conf["unite"] = choix_unite(jour_maxi)
-
- l_jours_conv = convertit_tableau(l_jours,conf["unite"],liste_err)
+ #debug("prématurité dans la config : "+conf["prematurite"],liste_err)
+ prema = int(convertit_jours_vers_python(conf["prematurite"],liste_err))
+ ## Gestion des prémas, deux cas :
+ # Si agecorrige est oui, alors on veut juste soustraire la valeur de préma
+ # à toutes les données.
+ # Si agecorrige est non, alors on veut ajouter la valeur de préma aux courbes de référence.
+
+ debug("Prématurité : "+str(prema)+" age corrigé : "+conf["agecorrige"],liste_err)
+
+ if prema>0 and conf["agecorrige"] == "oui":
+ l_jours = [j-prema for j in l_jours]
+ jour_maxi = jour_maxi - prema
+# debug("liste des jours : "+str(l_jours),liste_err)
+
+ l_jours_conv = convertit_tableau(l_jours,unite,liste_err)
# Attention, comme les jours commencent à partir de 0, faut enlever 1 pour avoir la borne...
- age_maxi = convertitunite(jour_maxi-1,conf["unite"],liste_err)
+ age_maxi = convertitunite(jour_maxi-1,unite,liste_err)
+ debug("cree_figure : conversion des unités ok : "+str(l_jours_conv),liste_err)
- titre = "Courbe de poids OMS"
-
-# warning("cree_figure : ça va jusque là ",liste_err)
- #warning("bli"+str(conf),liste_err)
- #warninf("coucou")
+ titre = "Courbe de "+typedonnee+" OMS"
if conf["typecourbe"] == "P":
# percentiles
liste_data_labels = liste_data_labels_p
if conf["sexe"] == "M":
- fichier_oms = f_poids_perc_garcon
+ fichier_oms = CONFIG["fichiersOMS"][typedonnee]["perc_garcon"]#f_poids_perc_garcon
titre += " (percentiles, garçon)"
elif conf["sexe"] == "F":
- fichier_oms = f_poids_perc_fille
+ fichier_oms = CONFIG["fichiersOMS"][typedonnee]["perc_fille"]
titre += " (percentiles, fille)"
else:
- fichier_oms = f_poids_perc_mixte
+ fichier_oms = CONFIG["fichiersOMS"][typedonnee]["perc_mixte"]
titre += " (percentiles)"
elif conf["typecourbe"] == "Z":
liste_data_labels = liste_data_labels_z
- if conf["sexe"] == "G":
- fichier_oms = f_poids_z_garcon
+ if conf["sexe"] == "M":
+ fichier_oms = CONFIG["fichiersOMS"][typedonnee]["z_garcon"]
titre += " (moyenne et écarts-types, garçon)"
elif conf["sexe"] == "F":
- fichier_oms = f_poids_z_fille
+ fichier_oms = CONFIG["fichiersOMS"][typedonnee]["z_fille"]
titre += " (moyenne et écarts-types, fille)"
else:
- fichier_oms = f_poids_z_mixte
+ fichier_oms = CONFIG["fichiersOMS"][typedonnee]["z_mixte"]
titre += " (moyenne et écarts-types)"
else:
- warning("Type de courbe invalide"+conf["typecourbe"],liste_err)
-
-# warning("cree_figure : ça va jusque là ",liste_err)
-# warning("bli"+str(conf),liste_err)
-
-
+ erreur("Type de courbe invalide"+conf["typecourbe"],liste_err)
+ return ""
+
# Si y'a un nom on met "courbe de machin"
if conf["nom"] !="":
titre += " de " +conf["nom"]
+
+
+ if prema>0:
+ titre+= ", préma de "+conf["prematurite"]
+ if conf["agecorrige"] == "oui":
+ titre+=" (courbe en âge corrigé)"
+ else:
+ titre+=" (courbe en âge réel, données OMS décalées)"
+
+ debug("cree_figure : géré le type de courbe ok. Liste des data labels : "+str(liste_data_labels),liste_err)
+ debug("Fichier d'où extraire les données : "+fichier_oms,liste_err)
+
# convertir les unités
-
+ #### Partie code OMS
#### On extrait les données des courbes, et on convertit les jours dans l'unité voulues
try:
t = lire_fichier_csv(fichier_oms)
except:
liste_err[0].append("Impossible d'ouvrir le fichier "+fichier_oms)
- coljour = convertit_tableau(extraire_colonne(t,0,jour_maxi),conf["unite"],liste_err)
+ return ""
+
+ debug("cree_figure : on va convertir données OMS à la bonne unité",liste_err)
+ try:
+ coljour= (extraire_colonne(t,0,jour_maxi))
+ if prema>0 and conf["agecorrige"] != "oui":
+ coljour = [j + prema for j in coljour]
+ coljour = convertit_tableau(coljour,unite,liste_err)
+ except:
+ erreur("Problème à la conversion du tableau OMS. jour_maxi = "+str(jour_maxi)+" unite = "+unite,liste_err)
+ return ""
+
+ debug("cree_figure : prête à créer la figure",liste_err)
+ #### La figure, params
-
- #### La figure
fig = plt.figure(num=None, figsize=(conf["largeur"], conf["hauteur"]), dpi=100, facecolor=conf["couleurs"]["fond"])
plt.rcParams['axes.facecolor'] = conf["couleurs"]["fond"]
plt.rcParams['axes.edgecolor']= conf["couleurs"]["cadretxt"]
plt.rcParams['grid.color'] = conf["couleurs"]["grille"]
plt.rcParams['legend.edgecolor'] = conf["couleurs"]["grille"]
- #warning("bla"+str(liste_data_labels),liste_err)
+ #Tracé des courbes OMS
for (i,label,couleur) in liste_data_labels:
plt.plot(coljour,extraire_colonne(t,i,jour_maxi),label=label,color=couleur)
#warning("colonne"+str(i)+str(label)+str(couleur),liste_err)
-
+ debug("cree_figure : tracé des courbes OMS ok",liste_err)
+
+
+ ##### Tracé des courbes OMS fini
# On extrait la valeur min et la valeur max des poids
(colonne_min,_,_) = liste_data_labels[-1]
(colonne_max,_,_) = liste_data_labels[0]
+ debug("cree_figure : colonnes min et max : "+str(colonne_min)+" "+str(colonne_max),liste_err)
+
poids_min = min(extraire_colonne(t,colonne_min,jour_maxi))
poids_max = max(extraire_colonne(t,colonne_max,jour_maxi))
if l_jours != []:
poids_min = max(0,poids_min-1)
#max : +5%
poids_max = poids_max * 1.05
+
- #warning("Jusque là ça marche",liste_err)
-
+ debug("cree_figure : prête à tracer la courbe de l'enfant",liste_err)
+
+ ### Tracé pour de bon
if l_jours != []:
- plt.plot(l_jours_conv,l_poids,label=conf["nom"],color=conf["couleur_cadretxt"],marker='o')
-
- plt.xlabel("Âge en "+conf["unite"],color=conf["couleurs"]["cadretxt"])
- plt.ylabel("Poids en kg",color=conf["couleurs"]["cadretxt"])
+ plt.plot(l_jours_conv,l_poids,label=conf["nom"],color=conf["couleurs"]["cadretxt"],marker='o')
+ debug("Tracé de la courbe enfant, avec les jours "+str(l_jours_conv),liste_err)
+
+ #### extrapolatios éventuelles
+ #print("prolongercourbes" in conf)
+ if conf["prolongercourbes"] == "oui":
+ #print("coucou")
+ # les dates, on prend tous les jours tant qu'à faire
+ date_fin = int(l_jours[-1])
+ dates_extrapole = list(range(date_fin, jour_maxi))
+ donnees_extrapole = prolongecourbe(t, date_fin, l_poids[-1], dates_extrapole, conf["typecourbe"], liste_err)
+ #print("données extrapolées !")
+ dates_extrapole = convertit_tableau(dates_extrapole,unite,liste_err)
+
+ # tracé des données extrapolées
+ plt.plot(dates_extrapole, donnees_extrapole,color=conf["couleurs"]["cadretxt"], linestyle=(0, (5,7)), marker=None)
+
+ else:
+ debug("On ne trace pas de courbe enfant", liste_err)
+
+ plt.xlabel("Âge en "+unite,color=conf["couleurs"]["cadretxt"])
+ plt.ylabel(typedonnee.capitalize()+" en "+CONFIG["unites_typedonnees"][typedonnee],color=conf["couleurs"]["cadretxt"])
+ #print("bla")
plt.title(titre,color=conf["couleurs"]["cadretxt"])
- plt.axis([0,age_maxi,poids_min,poids_max])
+ #print("ble")
+ if l_jours_conv == []:
+ plt.axis([0,age_maxi, poids_min, poids_max])
+ else:
+ plt.axis([min(0,l_jours_conv[0]),age_maxi,poids_min,poids_max])
+ #print("bli")
+
if conf['legende']=="oui":
legende = plt.legend(loc=conf['positionlegende'])
fig.tight_layout()
- #warning("Jusque là ça marche",liste_err)
- return fig
\ No newline at end of file
+ debug("Fin de cree_figure", liste_err)
+ return fig
+
+
+
+def prolongecourbe(tableauOMS, date, donnee, nouvdates, typecourbe, liste_err):
+ """ tableauOMS est le ableau des données OMS. date et donnee sont la date (jours)
+ et la dernière donnée d'où on extrapole. On veut les extrapolations à nouvdate
+ (tableaux de jours)
+ typecourbe est P ou Z. Pour P il faut commencer à regarder à l'indice 4, pour Z
+ à l'indice 1
+ On renvoie [] si pas pu extrapoler. """
+
+ # la ligne OMS
+ ligneoms = tableauOMS[date]
+ debug("prolongecourbe : Ligne OMS :"+str(ligneoms)+" valeur de donnée : "+str(donnee), liste_err)
+
+
+ # On cherche dans quel intervalle on se situe
+ if typecourbe == "P":
+ idep=4
+ else:
+ idep = 1
+ i = idep
+ while i<len(ligneoms) and ligneoms[i]<donnee:
+ i+=1
+ debug("prolongecourbe : on a trouvé la valeur de i : "+str(i),liste_err)
+ if i>=len(ligneoms):
+ warning("prolongation de courbe : pas réussi... donnée au dessus !", liste_err)
+ return []
+ if i==idep:
+ warning("prolongation de courbe : pas réussi... donnée en dessous !", liste_err)
+ return []
+
+ # Le coeff : donnee = coeff * l[i-1]+ (1-coeff)*ligne[i]
+ # On utilisera la même chose pour la nouvelle donnee
+ #print(ligneoms[i], ligneoms[i-1])
+ coeff = (donnee - ligneoms[i])/(ligneoms[i-1] - ligneoms[i])
+ #print("coeff : "+str(coeff))
+
+ # extrapolations
+ nouvdonnees = []
+ for j in nouvdates:
+ ligne2 = tableauOMS[j]
+ nouvdonnees.append(coeff*ligne2[i-1]+ (1-coeff)*ligne2[i])
+
+ return nouvdonnees
\ No newline at end of file