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-rw-r--r--trace_courbe.py93
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diff --git a/trace_courbe.py b/trace_courbe.py
index d004dcb..fab6471 100644
--- a/trace_courbe.py
+++ b/trace_courbe.py
@@ -51,15 +51,13 @@ def cree_figure(conf,l_jours,l_poids,typedonnee,liste_err):
51 # à toutes les données. 51 # à toutes les données.
52 # Si agecorrige est non, alors on veut ajouter la valeur de préma aux courbes de référence. 52 # Si agecorrige est non, alors on veut ajouter la valeur de préma aux courbes de référence.
53 53
54 debug("Prématurité : "+str(prema)+"age corrigé : "+conf["agecorrige"],liste_err) 54 debug("Prématurité : "+str(prema)+" age corrigé : "+conf["agecorrige"],liste_err)
55
56 55
57 if prema>0 and conf["agecorrige"] == "oui": 56 if prema>0 and conf["agecorrige"] == "oui":
58 l_jours = [j-prema for j in l_jours] 57 l_jours = [j-prema for j in l_jours]
59 jour_maxi = jour_maxi - prema 58 jour_maxi = jour_maxi - prema
60# debug("liste des jours : "+str(l_jours),liste_err) 59# debug("liste des jours : "+str(l_jours),liste_err)
61 else: 60
62 debug("bla",liste_err)
63 l_jours_conv = convertit_tableau(l_jours,unite,liste_err) 61 l_jours_conv = convertit_tableau(l_jours,unite,liste_err)
64 # Attention, comme les jours commencent à partir de 0, faut enlever 1 pour avoir la borne... 62 # Attention, comme les jours commencent à partir de 0, faut enlever 1 pour avoir la borne...
65 age_maxi = convertitunite(jour_maxi-1,unite,liste_err) 63 age_maxi = convertitunite(jour_maxi-1,unite,liste_err)
@@ -113,7 +111,7 @@ def cree_figure(conf,l_jours,l_poids,typedonnee,liste_err):
113 111
114 112
115 # convertir les unités 113 # convertir les unités
116 114 #### Partie code OMS
117 #### On extrait les données des courbes, et on convertit les jours dans l'unité voulues 115 #### On extrait les données des courbes, et on convertit les jours dans l'unité voulues
118 try: 116 try:
119 t = lire_fichier_csv(fichier_oms) 117 t = lire_fichier_csv(fichier_oms)
@@ -142,13 +140,16 @@ def cree_figure(conf,l_jours,l_poids,typedonnee,liste_err):
142 plt.rcParams['grid.color'] = conf["couleurs"]["grille"] 140 plt.rcParams['grid.color'] = conf["couleurs"]["grille"]
143 plt.rcParams['legend.edgecolor'] = conf["couleurs"]["grille"] 141 plt.rcParams['legend.edgecolor'] = conf["couleurs"]["grille"]
144 142
145 #warning("bla"+str(liste_data_labels),liste_err) 143 #Tracé des courbes OMS
146 for (i,label,couleur) in liste_data_labels: 144 for (i,label,couleur) in liste_data_labels:
147 plt.plot(coljour,extraire_colonne(t,i,jour_maxi),label=label,color=couleur) 145 plt.plot(coljour,extraire_colonne(t,i,jour_maxi),label=label,color=couleur)
148 #warning("colonne"+str(i)+str(label)+str(couleur),liste_err) 146 #warning("colonne"+str(i)+str(label)+str(couleur),liste_err)
149 147
150 debug("cree_figure : tracé des courbes OMS ok",liste_err) 148 debug("cree_figure : tracé des courbes OMS ok",liste_err)
151 149
150
151 ##### Tracé des courbes OMS fini
152
152 # On extrait la valeur min et la valeur max des poids 153 # On extrait la valeur min et la valeur max des poids
153 (colonne_min,_,_) = liste_data_labels[-1] 154 (colonne_min,_,_) = liste_data_labels[-1]
154 (colonne_max,_,_) = liste_data_labels[0] 155 (colonne_max,_,_) = liste_data_labels[0]
@@ -165,20 +166,43 @@ def cree_figure(conf,l_jours,l_poids,typedonnee,liste_err):
165 poids_min = max(0,poids_min-1) 166 poids_min = max(0,poids_min-1)
166 #max : +5% 167 #max : +5%
167 poids_max = poids_max * 1.05 168 poids_max = poids_max * 1.05
169
168 170
169 #warning("Jusque là ça marche",liste_err)
170 debug("cree_figure : prête à tracer la courbe de l'enfant",liste_err) 171 debug("cree_figure : prête à tracer la courbe de l'enfant",liste_err)
171 172
172
173 ### Tracé pour de bon 173 ### Tracé pour de bon
174 if l_jours != []: 174 if l_jours != []:
175 plt.plot(l_jours_conv,l_poids,label=conf["nom"],color=conf["couleurs"]["cadretxt"],marker='o') 175 plt.plot(l_jours_conv,l_poids,label=conf["nom"],color=conf["couleurs"]["cadretxt"],marker='o')
176 debug("Tracé de la courbe enfant, avec les jours "+str(l_jours_conv),liste_err) 176 debug("Tracé de la courbe enfant, avec les jours "+str(l_jours_conv),liste_err)
177 177
178 #### extrapolatios éventuelles
179 #print("prolongercourbes" in conf)
180 if conf["prolongercourbes"] == "oui":
181 #print("coucou")
182 # les dates, on prend tous les jours tant qu'à faire
183 date_fin = int(l_jours[-1])
184 dates_extrapole = list(range(date_fin, jour_maxi))
185 donnees_extrapole = prolongecourbe(t, date_fin, l_poids[-1], dates_extrapole, conf["typecourbe"], liste_err)
186 #print("données extrapolées !")
187 dates_extrapole = convertit_tableau(dates_extrapole,unite,liste_err)
188
189 # tracé des données extrapolées
190 plt.plot(dates_extrapole, donnees_extrapole,color=conf["couleurs"]["cadretxt"], linestyle=(0, (5,7)), marker=None)
191
192 else:
193 debug("On ne trace pas de courbe enfant", liste_err)
194
178 plt.xlabel("Âge en "+unite,color=conf["couleurs"]["cadretxt"]) 195 plt.xlabel("Âge en "+unite,color=conf["couleurs"]["cadretxt"])
179 plt.ylabel(typedonnee.capitalize()+" en "+CONFIG["unites_typedonnees"][typedonnee],color=conf["couleurs"]["cadretxt"]) 196 plt.ylabel(typedonnee.capitalize()+" en "+CONFIG["unites_typedonnees"][typedonnee],color=conf["couleurs"]["cadretxt"])
197 #print("bla")
180 plt.title(titre,color=conf["couleurs"]["cadretxt"]) 198 plt.title(titre,color=conf["couleurs"]["cadretxt"])
181 plt.axis([min(0,l_jours_conv[0]),age_maxi,poids_min,poids_max]) 199 #print("ble")
200 if l_jours_conv == []:
201 plt.axis([0,age_maxi, poids_min, poids_max])
202 else:
203 plt.axis([min(0,l_jours_conv[0]),age_maxi,poids_min,poids_max])
204 #print("bli")
205
182 206
183 if conf['legende']=="oui": 207 if conf['legende']=="oui":
184 legende = plt.legend(loc=conf['positionlegende']) 208 legende = plt.legend(loc=conf['positionlegende'])
@@ -187,5 +211,50 @@ def cree_figure(conf,l_jours,l_poids,typedonnee,liste_err):
187 211
188 fig.tight_layout() 212 fig.tight_layout()
189 213
190 #warning("Jusque là ça marche",liste_err) 214 debug("Fin de cree_figure", liste_err)
191 return fig \ No newline at end of file 215 return fig
216
217
218
219def prolongecourbe(tableauOMS, date, donnee, nouvdates, typecourbe, liste_err):
220 """ tableauOMS est le ableau des données OMS. date et donnee sont la date (jours)
221 et la dernière donnée d'où on extrapole. On veut les extrapolations à nouvdate
222 (tableaux de jours)
223 typecourbe est P ou Z. Pour P il faut commencer à regarder à l'indice 4, pour Z
224 à l'indice 1
225 On renvoie [] si pas pu extrapoler. """
226
227 # la ligne OMS
228 ligneoms = tableauOMS[date]
229 debug("prolongecourbe : Ligne OMS :"+str(ligneoms)+" valeur de donnée : "+str(donnee), liste_err)
230
231
232 # On cherche dans quel intervalle on se situe
233 if typecourbe == "P":
234 idep=4
235 else:
236 idep = 1
237 i = idep
238 while i<len(ligneoms) and ligneoms[i]<donnee:
239 i+=1
240 debug("prolongecourbe : on a trouvé la valeur de i : "+str(i),liste_err)
241 if i>=len(ligneoms):
242 warning("prolongation de courbe : pas réussi... donnée au dessus !", liste_err)
243 return []
244 if i==idep:
245 warning("prolongation de courbe : pas réussi... donnée en dessous !", liste_err)
246 return []
247
248 # Le coeff : donnee = coeff * l[i-1]+ (1-coeff)*ligne[i]
249 # On utilisera la même chose pour la nouvelle donnee
250 #print(ligneoms[i], ligneoms[i-1])
251 coeff = (donnee - ligneoms[i])/(ligneoms[i-1] - ligneoms[i])
252 #print("coeff : "+str(coeff))
253
254 # extrapolations
255 nouvdonnees = []
256 for j in nouvdates:
257 ligne2 = tableauOMS[j]
258 nouvdonnees.append(coeff*ligne2[i-1]+ (1-coeff)*ligne2[i])
259
260 return nouvdonnees \ No newline at end of file