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-rw-r--r-- | trace_courbe.py | 93 |
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diff --git a/trace_courbe.py b/trace_courbe.py index d004dcb..fab6471 100644 --- a/trace_courbe.py +++ b/trace_courbe.py | |||
@@ -51,15 +51,13 @@ def cree_figure(conf,l_jours,l_poids,typedonnee,liste_err): | |||
51 | # à toutes les données. | 51 | # à toutes les données. |
52 | # Si agecorrige est non, alors on veut ajouter la valeur de préma aux courbes de référence. | 52 | # Si agecorrige est non, alors on veut ajouter la valeur de préma aux courbes de référence. |
53 | 53 | ||
54 | debug("Prématurité : "+str(prema)+"age corrigé : "+conf["agecorrige"],liste_err) | 54 | debug("Prématurité : "+str(prema)+" age corrigé : "+conf["agecorrige"],liste_err) |
55 | |||
56 | 55 | ||
57 | if prema>0 and conf["agecorrige"] == "oui": | 56 | if prema>0 and conf["agecorrige"] == "oui": |
58 | l_jours = [j-prema for j in l_jours] | 57 | l_jours = [j-prema for j in l_jours] |
59 | jour_maxi = jour_maxi - prema | 58 | jour_maxi = jour_maxi - prema |
60 | # debug("liste des jours : "+str(l_jours),liste_err) | 59 | # debug("liste des jours : "+str(l_jours),liste_err) |
61 | else: | 60 | |
62 | debug("bla",liste_err) | ||
63 | l_jours_conv = convertit_tableau(l_jours,unite,liste_err) | 61 | l_jours_conv = convertit_tableau(l_jours,unite,liste_err) |
64 | # Attention, comme les jours commencent à partir de 0, faut enlever 1 pour avoir la borne... | 62 | # Attention, comme les jours commencent à partir de 0, faut enlever 1 pour avoir la borne... |
65 | age_maxi = convertitunite(jour_maxi-1,unite,liste_err) | 63 | age_maxi = convertitunite(jour_maxi-1,unite,liste_err) |
@@ -113,7 +111,7 @@ def cree_figure(conf,l_jours,l_poids,typedonnee,liste_err): | |||
113 | 111 | ||
114 | 112 | ||
115 | # convertir les unités | 113 | # convertir les unités |
116 | 114 | #### Partie code OMS | |
117 | #### On extrait les données des courbes, et on convertit les jours dans l'unité voulues | 115 | #### On extrait les données des courbes, et on convertit les jours dans l'unité voulues |
118 | try: | 116 | try: |
119 | t = lire_fichier_csv(fichier_oms) | 117 | t = lire_fichier_csv(fichier_oms) |
@@ -142,13 +140,16 @@ def cree_figure(conf,l_jours,l_poids,typedonnee,liste_err): | |||
142 | plt.rcParams['grid.color'] = conf["couleurs"]["grille"] | 140 | plt.rcParams['grid.color'] = conf["couleurs"]["grille"] |
143 | plt.rcParams['legend.edgecolor'] = conf["couleurs"]["grille"] | 141 | plt.rcParams['legend.edgecolor'] = conf["couleurs"]["grille"] |
144 | 142 | ||
145 | #warning("bla"+str(liste_data_labels),liste_err) | 143 | #Tracé des courbes OMS |
146 | for (i,label,couleur) in liste_data_labels: | 144 | for (i,label,couleur) in liste_data_labels: |
147 | plt.plot(coljour,extraire_colonne(t,i,jour_maxi),label=label,color=couleur) | 145 | plt.plot(coljour,extraire_colonne(t,i,jour_maxi),label=label,color=couleur) |
148 | #warning("colonne"+str(i)+str(label)+str(couleur),liste_err) | 146 | #warning("colonne"+str(i)+str(label)+str(couleur),liste_err) |
149 | 147 | ||
150 | debug("cree_figure : tracé des courbes OMS ok",liste_err) | 148 | debug("cree_figure : tracé des courbes OMS ok",liste_err) |
151 | 149 | ||
150 | |||
151 | ##### Tracé des courbes OMS fini | ||
152 | |||
152 | # On extrait la valeur min et la valeur max des poids | 153 | # On extrait la valeur min et la valeur max des poids |
153 | (colonne_min,_,_) = liste_data_labels[-1] | 154 | (colonne_min,_,_) = liste_data_labels[-1] |
154 | (colonne_max,_,_) = liste_data_labels[0] | 155 | (colonne_max,_,_) = liste_data_labels[0] |
@@ -165,20 +166,43 @@ def cree_figure(conf,l_jours,l_poids,typedonnee,liste_err): | |||
165 | poids_min = max(0,poids_min-1) | 166 | poids_min = max(0,poids_min-1) |
166 | #max : +5% | 167 | #max : +5% |
167 | poids_max = poids_max * 1.05 | 168 | poids_max = poids_max * 1.05 |
169 | |||
168 | 170 | ||
169 | #warning("Jusque là ça marche",liste_err) | ||
170 | debug("cree_figure : prête à tracer la courbe de l'enfant",liste_err) | 171 | debug("cree_figure : prête à tracer la courbe de l'enfant",liste_err) |
171 | 172 | ||
172 | |||
173 | ### Tracé pour de bon | 173 | ### Tracé pour de bon |
174 | if l_jours != []: | 174 | if l_jours != []: |
175 | plt.plot(l_jours_conv,l_poids,label=conf["nom"],color=conf["couleurs"]["cadretxt"],marker='o') | 175 | plt.plot(l_jours_conv,l_poids,label=conf["nom"],color=conf["couleurs"]["cadretxt"],marker='o') |
176 | debug("Tracé de la courbe enfant, avec les jours "+str(l_jours_conv),liste_err) | 176 | debug("Tracé de la courbe enfant, avec les jours "+str(l_jours_conv),liste_err) |
177 | 177 | ||
178 | #### extrapolatios éventuelles | ||
179 | #print("prolongercourbes" in conf) | ||
180 | if conf["prolongercourbes"] == "oui": | ||
181 | #print("coucou") | ||
182 | # les dates, on prend tous les jours tant qu'à faire | ||
183 | date_fin = int(l_jours[-1]) | ||
184 | dates_extrapole = list(range(date_fin, jour_maxi)) | ||
185 | donnees_extrapole = prolongecourbe(t, date_fin, l_poids[-1], dates_extrapole, conf["typecourbe"], liste_err) | ||
186 | #print("données extrapolées !") | ||
187 | dates_extrapole = convertit_tableau(dates_extrapole,unite,liste_err) | ||
188 | |||
189 | # tracé des données extrapolées | ||
190 | plt.plot(dates_extrapole, donnees_extrapole,color=conf["couleurs"]["cadretxt"], linestyle=(0, (5,7)), marker=None) | ||
191 | |||
192 | else: | ||
193 | debug("On ne trace pas de courbe enfant", liste_err) | ||
194 | |||
178 | plt.xlabel("Âge en "+unite,color=conf["couleurs"]["cadretxt"]) | 195 | plt.xlabel("Âge en "+unite,color=conf["couleurs"]["cadretxt"]) |
179 | plt.ylabel(typedonnee.capitalize()+" en "+CONFIG["unites_typedonnees"][typedonnee],color=conf["couleurs"]["cadretxt"]) | 196 | plt.ylabel(typedonnee.capitalize()+" en "+CONFIG["unites_typedonnees"][typedonnee],color=conf["couleurs"]["cadretxt"]) |
197 | #print("bla") | ||
180 | plt.title(titre,color=conf["couleurs"]["cadretxt"]) | 198 | plt.title(titre,color=conf["couleurs"]["cadretxt"]) |
181 | plt.axis([min(0,l_jours_conv[0]),age_maxi,poids_min,poids_max]) | 199 | #print("ble") |
200 | if l_jours_conv == []: | ||
201 | plt.axis([0,age_maxi, poids_min, poids_max]) | ||
202 | else: | ||
203 | plt.axis([min(0,l_jours_conv[0]),age_maxi,poids_min,poids_max]) | ||
204 | #print("bli") | ||
205 | |||
182 | 206 | ||
183 | if conf['legende']=="oui": | 207 | if conf['legende']=="oui": |
184 | legende = plt.legend(loc=conf['positionlegende']) | 208 | legende = plt.legend(loc=conf['positionlegende']) |
@@ -187,5 +211,50 @@ def cree_figure(conf,l_jours,l_poids,typedonnee,liste_err): | |||
187 | 211 | ||
188 | fig.tight_layout() | 212 | fig.tight_layout() |
189 | 213 | ||
190 | #warning("Jusque là ça marche",liste_err) | 214 | debug("Fin de cree_figure", liste_err) |
191 | return fig \ No newline at end of file | 215 | return fig |
216 | |||
217 | |||
218 | |||
219 | def prolongecourbe(tableauOMS, date, donnee, nouvdates, typecourbe, liste_err): | ||
220 | """ tableauOMS est le ableau des données OMS. date et donnee sont la date (jours) | ||
221 | et la dernière donnée d'où on extrapole. On veut les extrapolations à nouvdate | ||
222 | (tableaux de jours) | ||
223 | typecourbe est P ou Z. Pour P il faut commencer à regarder à l'indice 4, pour Z | ||
224 | à l'indice 1 | ||
225 | On renvoie [] si pas pu extrapoler. """ | ||
226 | |||
227 | # la ligne OMS | ||
228 | ligneoms = tableauOMS[date] | ||
229 | debug("prolongecourbe : Ligne OMS :"+str(ligneoms)+" valeur de donnée : "+str(donnee), liste_err) | ||
230 | |||
231 | |||
232 | # On cherche dans quel intervalle on se situe | ||
233 | if typecourbe == "P": | ||
234 | idep=4 | ||
235 | else: | ||
236 | idep = 1 | ||
237 | i = idep | ||
238 | while i<len(ligneoms) and ligneoms[i]<donnee: | ||
239 | i+=1 | ||
240 | debug("prolongecourbe : on a trouvé la valeur de i : "+str(i),liste_err) | ||
241 | if i>=len(ligneoms): | ||
242 | warning("prolongation de courbe : pas réussi... donnée au dessus !", liste_err) | ||
243 | return [] | ||
244 | if i==idep: | ||
245 | warning("prolongation de courbe : pas réussi... donnée en dessous !", liste_err) | ||
246 | return [] | ||
247 | |||
248 | # Le coeff : donnee = coeff * l[i-1]+ (1-coeff)*ligne[i] | ||
249 | # On utilisera la même chose pour la nouvelle donnee | ||
250 | #print(ligneoms[i], ligneoms[i-1]) | ||
251 | coeff = (donnee - ligneoms[i])/(ligneoms[i-1] - ligneoms[i]) | ||
252 | #print("coeff : "+str(coeff)) | ||
253 | |||
254 | # extrapolations | ||
255 | nouvdonnees = [] | ||
256 | for j in nouvdates: | ||
257 | ligne2 = tableauOMS[j] | ||
258 | nouvdonnees.append(coeff*ligne2[i-1]+ (1-coeff)*ligne2[i]) | ||
259 | |||
260 | return nouvdonnees \ No newline at end of file | ||