#!/usr/bin/env python3
# -*- coding: utf-8 -*-
from configuration import CONFIG
import gestionOMS as oms
import gestion_unites as u
from gestion_donnees import calcule_max_graphique, convertit_jours_vers_python
from gestion_erreurs import debug, erreur, warning
from numpy import arange
import matplotlib.pyplot as plt
# Essentiellement, la fonction qui trace la courbe
def cree_figure(conf,l_jours,l_poids,typedonnee,liste_err):
""" conf est le dictionnaire de config. l_jours et l_poids les listes des temps (en jours) et de données
(donc pas forcément du poids)
typedonnee est le type de données (voir CONFIG["liste_typedonnees"]
liste_err la liste des erreurs à compléter (voir gestion_erreurs))
Renvoie la figure tracée"""
debug("debut de cree_figure. Config : "+str(conf),liste_err)
try:
liste_data_labels_p,liste_data_labels_z = oms.renvoie_liste_labels(conf,CONFIG["liste_data_choisie_p"],CONFIG["liste_data_choisie_z"],liste_err)
except:
erreur("bug avec liste data labels",liste_err)
return ""
######################## Gestion des bornes #############################
# y a-t-il un maxi saisi par l'utilisateur ?
if conf["maxi"] ==0:
# Est-ce qu'on a donné un maxi quand même (car même échelle) ?
if conf["non_sauve"].get("maxi",0) == 0:
jour_maxi = calcule_max_graphique(l_jours)
else:
jour_maxi = conf["non_sauve"]["maxi"]+1
else:
jour_maxi = conf["maxi"]+1
# On s'assure que c'est bien compris dans les bornes
jour_maxi = max(CONFIG["jours_mini_courbe"],min(jour_maxi,CONFIG["jours_maxi_courbe"]))
debug("cree_figure : gestion du jour max : "+str(jour_maxi),liste_err)
##################### Gestion des unités ###############################
# si l'unité n'est pas précisée, ni en "non sauvé" ni par l'utilisateur
if conf["unite"] == "" and conf["non_sauve"].get("unite","") == "":
unite = u.choix_unite(jour_maxi)
debug("Unité non précisée, on choisit "+unite,liste_err)
elif conf["unite"] != "":
unite = conf["unite"]
else:
unite = conf["non_sauve"]["unite"]
##################### Gestion de la prématurité #######################"
prema = int(convertit_jours_vers_python(conf["prematurite"],liste_err))
## Gestion des prémas, deux cas :
# Si agecorrige est oui, alors on veut juste soustraire la valeur de préma
# à toutes les données.
# Si agecorrige est non, alors on veut ajouter la valeur de préma aux courbes de référence.
debug("Prématurité : "+str(prema)+" age corrigé : "+conf["agecorrige"],liste_err)
if prema>0 and conf["agecorrige"] == "oui":
l_jours = [j-prema for j in l_jours]
jour_maxi = jour_maxi - prema
###################### Conversion des unités ###########################""
l_jours_conv = u.convertit_tableau(l_jours,unite,liste_err)
# Attention, comme les jours commencent à partir de 0, faut enlever 1 pour avoir la borne...
age_maxi = u.convertitunite(jour_maxi-1,unite,liste_err)
debug("cree_figure : conversion des unités ok : "+str(l_jours_conv),liste_err)
#####################" Courbes OMS et titre ######################################"
titre = "Courbe de "+typedonnee+" OMS"
if conf["typecourbe"] == "P":
# percentiles
liste_data_labels = liste_data_labels_p
if conf["sexe"] == "M":
fichier_oms = CONFIG["fichiersOMS"][typedonnee]["perc_garcon"]#f_poids_perc_garcon
titre += " (percentiles, garçon)"
elif conf["sexe"] == "F":
fichier_oms = CONFIG["fichiersOMS"][typedonnee]["perc_fille"]
titre += " (percentiles, fille)"
else:
fichier_oms = CONFIG["fichiersOMS"][typedonnee]["perc_mixte"]
titre += " (percentiles)"
elif conf["typecourbe"] == "Z":
liste_data_labels = liste_data_labels_z
if conf["sexe"] == "M":
fichier_oms = CONFIG["fichiersOMS"][typedonnee]["z_garcon"]
titre += " (moyenne et écarts-types, garçon)"
elif conf["sexe"] == "F":
fichier_oms = CONFIG["fichiersOMS"][typedonnee]["z_fille"]
titre += " (moyenne et écarts-types, fille)"
else:
fichier_oms = CONFIG["fichiersOMS"][typedonnee]["z_mixte"]
titre += " (moyenne et écarts-types)"
else:
erreur("Type de courbe invalide"+conf["typecourbe"],liste_err)
return ""
# Si y'a un nom on met "courbe de machin"
if conf["nom"] !="":
titre += " de " +conf["nom"]
if prema>0:
titre+= ", préma de "+conf["prematurite"]
if conf["agecorrige"] == "oui":
titre+=" (courbe en âge corrigé)"
else:
titre+=" (courbe en âge réel, données OMS décalées)"
#debug("cree_figure : géré le type de courbe ok. Liste des data labels : "+str(liste_data_labels),liste_err)
debug("Fichier d'où extraire les données : "+fichier_oms,liste_err)
#### On extrait les données des courbes, et on convertit les jours dans l'unité voulues
try:
t = oms.lire_fichier_csv(fichier_oms)
except:
erreur("cree_figure : Impossible d'ouvrir le fichier "+fichier_oms, liste_err)
return ""
debug("cree_figure : Conversion des données OMS à la bonne unité",liste_err)
try:
coljour= (oms.extraire_colonne(t,0,jour_maxi))
if prema>0 and conf["agecorrige"] != "oui":
coljour = [j + prema for j in coljour]
coljour = u.convertit_tableau(coljour,unite,liste_err)
except:
erreur("Problème à la conversion du tableau OMS. jour_maxi = "+str(jour_maxi)+" unite = "+unite,liste_err)
return ""
##################### Création de la figure et du graphique ###################
debug("cree_figure : prête à créer la figure",liste_err)
#### La figure, params
fig = plt.figure(num=None, figsize=(conf["largeur"], conf["hauteur"]), dpi=100, facecolor=conf["couleurs"]["fond"])
plt.rcParams['axes.facecolor'] = conf["couleurs"]["fond"]
plt.rcParams['axes.edgecolor']= conf["couleurs"]["cadretxt"]
plt.rcParams['xtick.color'] = conf["couleurs"]["cadretxt"]
plt.rcParams['ytick.color'] = conf["couleurs"]["cadretxt"]
plt.rcParams['grid.color'] = conf["couleurs"]["grille"]
plt.rcParams['legend.edgecolor'] = conf["couleurs"]["grille"]
ax = plt.axes()
###################### Tracé des différentes courbes
#Tracé des courbes OMS
for (i,label,couleur) in liste_data_labels:
ax.plot(coljour,oms.extraire_colonne(t,i,jour_maxi),label=label,color=couleur)
debug("cree_figure : tracé des courbes OMS ok",liste_err)
### Tracé pour de bon
if l_jours != []:
ax.plot(l_jours_conv,l_poids,label=conf["nom"],color=conf["couleurs"]["cadretxt"],marker='o')
debug("Tracé de la courbe enfant, avec les jours "+str(l_jours_conv),liste_err)
#### extrapolatios éventuelles
#print("prolongercourbes" in conf)
if conf["prolongercourbes"] == "oui":
#print("coucou")
# les dates, on prend tous les jours tant qu'à faire
date_fin = int(l_jours[-1])
dates_extrapole = list(range(date_fin, jour_maxi))
donnees_extrapole = prolongecourbe(t, date_fin, l_poids[-1], dates_extrapole, conf["typecourbe"], liste_err)
#print("données extrapolées !")
dates_extrapole = u.convertit_tableau(dates_extrapole,unite,liste_err)
# tracé des données extrapolées
plt.plot(dates_extrapole, donnees_extrapole,color=conf["couleurs"]["cadretxt"], linestyle=(0, (5,7)), marker=None)
debug("Tracé de la courbe extrapolée ok", liste_err)
else:
debug("On ne trace pas de courbe enfant", liste_err)
###################" Gestion de l'échelle #####################
debug("Courbes tracées. Il n'y a plus qu'à gérer l'échelle", liste_err)
### échelle à régler
# On extrait la valeur min et la valeur max des poids des courbes OMS et des données
(colonne_min,_,_) = liste_data_labels[-1]
(colonne_max,_,_) = liste_data_labels[0]
# poids max OMS
poids_min = min(oms.extraire_colonne(t,colonne_min,jour_maxi))
poids_max = max(oms.extraire_colonne(t,colonne_max,jour_maxi))
if l_jours != []:
poids_min = min(min(l_poids),poids_min)
# Pour le poids max, voir la dernière valeur du tableau
i = 0
while i<len(l_jours) and l_jours[i]<jour_maxi:
i=i+1
poids_max = max(max(l_poids[0:i+1]),poids_max)
# On ajuste un peu ces min et max
# min : valeur min -1kg
poids_min = max(0,poids_min-1)
#max : +5%
poids_max = poids_max * 1.05
# Grille custom ?
if conf["non_sauve"]["grilleamelio"] == "oui":
debug("On a choisi la grille plus jolie", liste_err)
pas=u.choix_echelle_data(typedonnee, poids_max)
# data_min_arrondie
minechelle = int(poids_min/pas[0])*pas[0]
debug("pas choisis pour l'échelle en y : "+str(pas), liste_err)
echellemajeure = arange(minechelle, poids_max, pas[0])
if pas[1] >0:
echellemineure = arange(minechelle, poids_max, pas[1])
else:
echellemineure = []
ax.set_yticks(echellemajeure, minor=False)
ax.set_yticks(echellemineure, minor=True)
# échelle en temps
pas=u.choix_echelle_temps(unite, age_maxi)
debug("pas choisis pour l'échelle en x : "+str(pas), liste_err)
echellemajeure = arange(0,age_maxi, pas[0])
if pas[1] >0:
echellemineure = arange(0,age_maxi, pas[1])
else:
echellemineure = []
ax.set_xticks(echellemajeure, minor=False)
ax.set_xticks(echellemineure, minor=True)
################################# Aspect du graphique
debug("On commende la déco du graphique", liste_err)
# La grille
ax.grid(conf["grille"]=="oui")
ax.grid(conf["grille"] == "oui", which="minor", linestyle="--")
plt.xlabel("Âge en "+unite,color=conf["couleurs"]["cadretxt"])
plt.ylabel(typedonnee.capitalize()+" en "+CONFIG["unites_typedonnees"][typedonnee],color=conf["couleurs"]["cadretxt"])
#print("bla")
plt.title(titre,color=conf["couleurs"]["cadretxt"])
#print("ble")
if l_jours_conv == []:
plt.axis([0,age_maxi, poids_min, poids_max])
else:
plt.axis([min(0,l_jours_conv[0]),age_maxi,poids_min,poids_max])
#print("bli")
if conf['legende']=="oui":
legende = plt.legend(loc=conf['positionlegende'])
plt.setp(legende.get_texts(), color=conf["couleurs"]["cadretxt"])
fig.tight_layout()
debug("Fin de cree_figure, tout va bien.", liste_err)
return fig
######################################## Pour extrapoler la courbe
def prolongecourbe(tableauOMS, date, donnee, nouvdates, typecourbe, liste_err):
""" tableauOMS est le ableau des données OMS. date et donnee sont la date (jours)
et la dernière donnée d'où on extrapole. On veut les extrapolations à nouvdate
(tableaux de jours)
typecourbe est P ou Z. Pour P il faut commencer à regarder à l'indice 4, pour Z
à l'indice 1
On renvoie [] si pas pu extrapoler. """
# la ligne OMS
ligneoms = tableauOMS[date]
debug("prolongecourbe : Ligne OMS :"+str(ligneoms)+" valeur de donnée : "+str(donnee), liste_err)
# On cherche dans quel intervalle on se situe
if typecourbe == "P":
idep=4
else:
idep = 1
i = idep
while i<len(ligneoms) and ligneoms[i]<donnee:
i+=1
debug("prolongecourbe : on a trouvé la valeur de i : "+str(i),liste_err)
if i>=len(ligneoms):
warning("prolongation de courbe : pas réussi... donnée trop haute !", liste_err)
return []
if i==idep:
warning("prolongation de courbe : pas réussi... donnée trop basse !", liste_err)
return []
# Le coeff : donnee = coeff * l[i-1]+ (1-coeff)*ligne[i]
# On utilisera la même chose pour la nouvelle donnee
coeff = (donnee - ligneoms[i])/(ligneoms[i-1] - ligneoms[i])
# extrapolations
nouvdonnees = []
for j in nouvdates:
ligne2 = tableauOMS[j]
nouvdonnees.append(coeff*ligne2[i-1]+ (1-coeff)*ligne2[i])
return nouvdonnees
