X-Git-Url: https://git.immae.eu/?p=perso%2FDenise%2Foms.git;a=blobdiff_plain;f=trace_courbe.py;h=fab64718c0f7508795f13fea2854b268e5b3d19e;hp=4ccc6ebfb1efea5c058dfd4937cd20a69eca7816;hb=c2fe511bb9e6974cc267b8926a47b1fa81b37da3;hpb=9e4c51c76d337e1f8c757cd2f99a4eed615687b4 diff --git a/trace_courbe.py b/trace_courbe.py index 4ccc6eb..fab6471 100644 --- a/trace_courbe.py +++ b/trace_courbe.py @@ -1,94 +1,137 @@ #!/usr/bin/env python3 # -*- coding: utf-8 -*- -from configuration import * +from configuration import CONFIG from gestionOMS import * from gestion_unites import * +from gestion_donnees import calcule_max_graphique, convertit_jours_vers_python import matplotlib.pyplot as plt -def cree_figure(conf,l_jours,l_poids,liste_err): - #warning("debut de cree_figure"+str(conf),liste_err) +# Essentiellement, la fonction qui trace la courbe + + +def cree_figure(conf,l_jours,l_poids,typedonnee,liste_err): + debug("debut de cree_figure",liste_err) try: - liste_data_labels_p,liste_data_labels_z = renvoie_liste_labels(conf,liste_data_choisie_p,liste_data_choisie_z,liste_err) + liste_data_labels_p,liste_data_labels_z = renvoie_liste_labels(conf,CONFIG["liste_data_choisie_p"],CONFIG["liste_data_choisie_z"],liste_err) except: erreur("bug avec liste data labels",liste_err) return "" - #warning("bla",liste_err) + # maxi saisi par l'utilisateur ? if conf["maxi"] ==0: - if l_jours != []: - jour_maxi = max(l_jours)# pas la peine d'aller très au delà du jour max - jour_maxi = int(jour_maxi* 1.1)+3 # on rajoute un peu + # Est-ce qu'on a donné un maxi quand même (car même échelle) ? + print(conf) + print(conf["non_sauve"]) + if conf["non_sauve"].get("maxi",0) == 0: + jour_maxi = calcule_max_graphique(l_jours) else: - jour_maxi = int(6*jours_dans_mois) # si pas de données, arbitrairement on met ça + jour_maxi = conf["non_sauve"]["maxi"]+1 else: jour_maxi = conf["maxi"]+1 - + + # On s'assure que c'est bien compris dans les bornes - #warning("bla"+str(jour_maxi),liste_err) jour_maxi = max(CONFIG["jours_mini_courbe"],min(jour_maxi,CONFIG["jours_maxi_courbe"])) - #warning("bla"+str(jour_maxi),liste_err) + debug("cree_figure : gestion du jour max ok : "+str(jour_maxi),liste_err) - if conf["unite"] == "": - conf["unite"] = choix_unite(jour_maxi) - - l_jours_conv = convertit_tableau(l_jours,conf["unite"],liste_err) - # Attention, comme les jours commencent à partir de 0, faut enlever 1 pour avoir la borne... - age_maxi = convertitunite(jour_maxi-1,conf["unite"],liste_err) + # si l'unité n'est pas précisée, ni en "non sauvé" ni par l'utilisateur + if conf["unite"] == "" and conf["non_sauve"].get("unite","") == "": + unite = choix_unite(jour_maxi) + debug("Unité non précisée, on choisit "+unite,liste_err) + elif conf["unite"] != "": + unite = conf["unite"] + else: + unite = conf["non_sauve"]["unite"] + #debug("prématurité dans la config : "+conf["prematurite"],liste_err) + prema = int(convertit_jours_vers_python(conf["prematurite"],liste_err)) + ## Gestion des prémas, deux cas : + # Si agecorrige est oui, alors on veut juste soustraire la valeur de préma + # à toutes les données. + # Si agecorrige est non, alors on veut ajouter la valeur de préma aux courbes de référence. + + debug("Prématurité : "+str(prema)+" age corrigé : "+conf["agecorrige"],liste_err) + + if prema>0 and conf["agecorrige"] == "oui": + l_jours = [j-prema for j in l_jours] + jour_maxi = jour_maxi - prema +# debug("liste des jours : "+str(l_jours),liste_err) - titre = "Courbe de poids OMS" + l_jours_conv = convertit_tableau(l_jours,unite,liste_err) + # Attention, comme les jours commencent à partir de 0, faut enlever 1 pour avoir la borne... + age_maxi = convertitunite(jour_maxi-1,unite,liste_err) - #warning("cree_figure : ça va jusque là ",liste_err) - #warning("bli"+str(conf),liste_err) - #warninf("coucou") + debug("cree_figure : conversion des unités ok : "+str(l_jours_conv),liste_err) + + titre = "Courbe de "+typedonnee+" OMS" if conf["typecourbe"] == "P": # percentiles liste_data_labels = liste_data_labels_p if conf["sexe"] == "M": - fichier_oms = f_poids_perc_garcon + fichier_oms = CONFIG["fichiersOMS"][typedonnee]["perc_garcon"]#f_poids_perc_garcon titre += " (percentiles, garçon)" elif conf["sexe"] == "F": - fichier_oms = f_poids_perc_fille + fichier_oms = CONFIG["fichiersOMS"][typedonnee]["perc_fille"] titre += " (percentiles, fille)" else: - fichier_oms = f_poids_perc_mixte + fichier_oms = CONFIG["fichiersOMS"][typedonnee]["perc_mixte"] titre += " (percentiles)" elif conf["typecourbe"] == "Z": liste_data_labels = liste_data_labels_z - if conf["sexe"] == "G": - fichier_oms = f_poids_z_garcon + if conf["sexe"] == "M": + fichier_oms = CONFIG["fichiersOMS"][typedonnee]["z_garcon"] titre += " (moyenne et écarts-types, garçon)" elif conf["sexe"] == "F": - fichier_oms = f_poids_z_fille + fichier_oms = CONFIG["fichiersOMS"][typedonnee]["z_fille"] titre += " (moyenne et écarts-types, fille)" else: - fichier_oms = f_poids_z_mixte + fichier_oms = CONFIG["fichiersOMS"][typedonnee]["z_mixte"] titre += " (moyenne et écarts-types)" else: - warning("Type de courbe invalide"+conf["typecourbe"],liste_err) - -# warning("cree_figure : ça va jusque là ",liste_err) -# warning("bli"+str(conf),liste_err) - - + erreur("Type de courbe invalide"+conf["typecourbe"],liste_err) + return "" + # Si y'a un nom on met "courbe de machin" if conf["nom"] !="": titre += " de " +conf["nom"] + + + if prema>0: + titre+= ", préma de "+conf["prematurite"] + if conf["agecorrige"] == "oui": + titre+=" (courbe en âge corrigé)" + else: + titre+=" (courbe en âge réel, données OMS décalées)" + + debug("cree_figure : géré le type de courbe ok. Liste des data labels : "+str(liste_data_labels),liste_err) + debug("Fichier d'où extraire les données : "+fichier_oms,liste_err) + # convertir les unités - + #### Partie code OMS #### On extrait les données des courbes, et on convertit les jours dans l'unité voulues try: t = lire_fichier_csv(fichier_oms) except: liste_err[0].append("Impossible d'ouvrir le fichier "+fichier_oms) - coljour = convertit_tableau(extraire_colonne(t,0,jour_maxi),conf["unite"],liste_err) + return "" + + debug("cree_figure : on va convertir données OMS à la bonne unité",liste_err) + try: + coljour= (extraire_colonne(t,0,jour_maxi)) + if prema>0 and conf["agecorrige"] != "oui": + coljour = [j + prema for j in coljour] + coljour = convertit_tableau(coljour,unite,liste_err) + except: + erreur("Problème à la conversion du tableau OMS. jour_maxi = "+str(jour_maxi)+" unite = "+unite,liste_err) + return "" + + debug("cree_figure : prête à créer la figure",liste_err) + #### La figure, params - - #### La figure fig = plt.figure(num=None, figsize=(conf["largeur"], conf["hauteur"]), dpi=100, facecolor=conf["couleurs"]["fond"]) plt.rcParams['axes.facecolor'] = conf["couleurs"]["fond"] plt.rcParams['axes.edgecolor']= conf["couleurs"]["cadretxt"] @@ -97,17 +140,22 @@ def cree_figure(conf,l_jours,l_poids,liste_err): plt.rcParams['grid.color'] = conf["couleurs"]["grille"] plt.rcParams['legend.edgecolor'] = conf["couleurs"]["grille"] - #warning("bla"+str(liste_data_labels),liste_err) + #Tracé des courbes OMS for (i,label,couleur) in liste_data_labels: plt.plot(coljour,extraire_colonne(t,i,jour_maxi),label=label,color=couleur) #warning("colonne"+str(i)+str(label)+str(couleur),liste_err) - + debug("cree_figure : tracé des courbes OMS ok",liste_err) + + + ##### Tracé des courbes OMS fini # On extrait la valeur min et la valeur max des poids (colonne_min,_,_) = liste_data_labels[-1] (colonne_max,_,_) = liste_data_labels[0] + debug("cree_figure : colonnes min et max : "+str(colonne_min)+" "+str(colonne_max),liste_err) + poids_min = min(extraire_colonne(t,colonne_min,jour_maxi)) poids_max = max(extraire_colonne(t,colonne_max,jour_maxi)) if l_jours != []: @@ -118,16 +166,43 @@ def cree_figure(conf,l_jours,l_poids,liste_err): poids_min = max(0,poids_min-1) #max : +5% poids_max = poids_max * 1.05 + - #warning("Jusque là ça marche",liste_err) - + debug("cree_figure : prête à tracer la courbe de l'enfant",liste_err) + + ### Tracé pour de bon if l_jours != []: - plt.plot(l_jours_conv,l_poids,label=conf["nom"],color=conf["couleur_cadretxt"],marker='o') - - plt.xlabel("Âge en "+conf["unite"],color=conf["couleurs"]["cadretxt"]) - plt.ylabel("Poids en kg",color=conf["couleurs"]["cadretxt"]) + plt.plot(l_jours_conv,l_poids,label=conf["nom"],color=conf["couleurs"]["cadretxt"],marker='o') + debug("Tracé de la courbe enfant, avec les jours "+str(l_jours_conv),liste_err) + + #### extrapolatios éventuelles + #print("prolongercourbes" in conf) + if conf["prolongercourbes"] == "oui": + #print("coucou") + # les dates, on prend tous les jours tant qu'à faire + date_fin = int(l_jours[-1]) + dates_extrapole = list(range(date_fin, jour_maxi)) + donnees_extrapole = prolongecourbe(t, date_fin, l_poids[-1], dates_extrapole, conf["typecourbe"], liste_err) + #print("données extrapolées !") + dates_extrapole = convertit_tableau(dates_extrapole,unite,liste_err) + + # tracé des données extrapolées + plt.plot(dates_extrapole, donnees_extrapole,color=conf["couleurs"]["cadretxt"], linestyle=(0, (5,7)), marker=None) + + else: + debug("On ne trace pas de courbe enfant", liste_err) + + plt.xlabel("Âge en "+unite,color=conf["couleurs"]["cadretxt"]) + plt.ylabel(typedonnee.capitalize()+" en "+CONFIG["unites_typedonnees"][typedonnee],color=conf["couleurs"]["cadretxt"]) + #print("bla") plt.title(titre,color=conf["couleurs"]["cadretxt"]) - plt.axis([0,age_maxi,poids_min,poids_max]) + #print("ble") + if l_jours_conv == []: + plt.axis([0,age_maxi, poids_min, poids_max]) + else: + plt.axis([min(0,l_jours_conv[0]),age_maxi,poids_min,poids_max]) + #print("bli") + if conf['legende']=="oui": legende = plt.legend(loc=conf['positionlegende']) @@ -136,5 +211,50 @@ def cree_figure(conf,l_jours,l_poids,liste_err): fig.tight_layout() - #warning("Jusque là ça marche",liste_err) - return fig \ No newline at end of file + debug("Fin de cree_figure", liste_err) + return fig + + + +def prolongecourbe(tableauOMS, date, donnee, nouvdates, typecourbe, liste_err): + """ tableauOMS est le ableau des données OMS. date et donnee sont la date (jours) + et la dernière donnée d'où on extrapole. On veut les extrapolations à nouvdate + (tableaux de jours) + typecourbe est P ou Z. Pour P il faut commencer à regarder à l'indice 4, pour Z + à l'indice 1 + On renvoie [] si pas pu extrapoler. """ + + # la ligne OMS + ligneoms = tableauOMS[date] + debug("prolongecourbe : Ligne OMS :"+str(ligneoms)+" valeur de donnée : "+str(donnee), liste_err) + + + # On cherche dans quel intervalle on se situe + if typecourbe == "P": + idep=4 + else: + idep = 1 + i = idep + while i=len(ligneoms): + warning("prolongation de courbe : pas réussi... donnée au dessus !", liste_err) + return [] + if i==idep: + warning("prolongation de courbe : pas réussi... donnée en dessous !", liste_err) + return [] + + # Le coeff : donnee = coeff * l[i-1]+ (1-coeff)*ligne[i] + # On utilisera la même chose pour la nouvelle donnee + #print(ligneoms[i], ligneoms[i-1]) + coeff = (donnee - ligneoms[i])/(ligneoms[i-1] - ligneoms[i]) + #print("coeff : "+str(coeff)) + + # extrapolations + nouvdonnees = [] + for j in nouvdates: + ligne2 = tableauOMS[j] + nouvdonnees.append(coeff*ligne2[i-1]+ (1-coeff)*ligne2[i]) + + return nouvdonnees \ No newline at end of file