X-Git-Url: https://git.immae.eu/?p=perso%2FDenise%2Foms.git;a=blobdiff_plain;f=trace_courbe.py;h=ed5f980b584e26e47b20c9f491bfeb6961ef5183;hp=28ee5b4c29b99ca523e900223f9dff7d0448a653;hb=7b1f383214c0a3e351bf0f369b0d1737e37980d1;hpb=3d7da80ac11bb87ab441fb51f93b738be02de2c3 diff --git a/trace_courbe.py b/trace_courbe.py index 28ee5b4..ed5f980 100644 --- a/trace_courbe.py +++ b/trace_courbe.py @@ -3,9 +3,10 @@ from configuration import CONFIG import gestionOMS as oms import gestion_unites as u -from gestion_donnees import calcule_max_graphique, convertit_jours_vers_python, convertit_age_vers_texte +from gestion_donnees import calcule_max_graphique, convertit_jours_vers_python, simplifie_nom from gestion_erreurs import debug, erreur, warning from calculs_extrapole import calcule_donnee_extrapolee, calcule_age_extrapole, interpole_lineaire, interpole_lineaire_ordonnee, formate_resultat_donnee, formate_resultat_age, formate_interpole, formate_extrapole +import datetime from numpy import arange @@ -16,14 +17,19 @@ import matplotlib.pyplot as plt # Ainsi que les calculs additionnels. -def cree_figure(conf,l_jours,l_poids,typedonnee,liste_extracalculs, liste_err): +def cree_figure(conf,l_jours,l_poids,typedonnee,liste_extracalculs, liste_err, enfants_add = []): """ conf est le dictionnaire de config. l_jours et l_poids les listes des temps (en jours) et de données (donc pas forcément du poids) typedonnee est le type de données (voir CONFIG["liste_typedonnees"] liste_err la liste des erreurs à compléter (voir gestion_erreurs)) Renvoie la figure tracée, et les calculs additionnels sont mis sous forme de chaîne dans la liste - liste_extracalculs""" - debug("debut de cree_figure. Config : "+str(conf),liste_err) + liste_extracalculs + + Les enfants en plus sont dans la liste enfants_add. Pour chaque item de la liste, il faut prendre + item[typed] pour avoir accès au nom, ljours, et ldonnees + + """ + debug("debut de cree_figure. Config : "+str(conf)+". Nombre d'enfants additionnels : "+str(len(enfants_add)),liste_err) try: liste_data_labels_p,liste_data_labels_z = oms.renvoie_liste_labels(conf,CONFIG["liste_data_choisie_p"],CONFIG["liste_data_choisie_z"],liste_err) except: @@ -41,6 +47,10 @@ def cree_figure(conf,l_jours,l_poids,typedonnee,liste_extracalculs, liste_err): else: jour_maxi = conf["maxi"]+1 + # Si on cherche à extrapoler au-delà + if conf["non_sauve"]["calculextradata_type"] == typedonnee and conf["non_sauve"]["calculextradata_age"]>jour_maxi: + jour_maxi = int(conf["non_sauve"]["calculextradata_age"]) +1 + # On s'assure que c'est bien compris dans les bornes jour_maxi = max(CONFIG["jours_mini_courbe"],min(jour_maxi,CONFIG["jours_maxi_courbe"])) debug("cree_figure : gestion du jour max : "+str(jour_maxi),liste_err) @@ -64,7 +74,8 @@ def cree_figure(conf,l_jours,l_poids,typedonnee,liste_extracalculs, liste_err): debug("Prématurité : "+str(prema)+" age corrigé : "+conf["agecorrige"],liste_err) if prema>0 and conf["agecorrige"] == "oui": l_jours = [j-prema for j in l_jours] - jour_maxi = jour_maxi - prema + jour_maxi = max(jour_maxi - prema, 2) + ## Si le jour maxi est <0 on met minimum 1 jour quand même ! ###################### Conversion des unités ###########################"" @@ -103,16 +114,7 @@ def cree_figure(conf,l_jours,l_poids,typedonnee,liste_extracalculs, liste_err): erreur("Type de courbe invalide"+conf["typecourbe"],liste_err) return "" - # Si y'a un nom on met "courbe de machin" - if conf["nom"] !="": - titre += " de " +conf["nom"] - - if prema>0: - titre+= ", préma de "+conf["prematurite"] - if conf["agecorrige"] == "oui": - titre+=" (courbe en âge corrigé)" - else: - titre+=" (courbe en âge réel, données OMS décalées)" + ## On finira le titre plus tard quand on aura su qui est concerné #debug("cree_figure : géré le type de courbe ok. Liste des data labels : "+str(liste_data_labels),liste_err) debug("Fichier d'où extraire les données : "+fichier_oms,liste_err) @@ -157,14 +159,61 @@ def cree_figure(conf,l_jours,l_poids,typedonnee,liste_extracalculs, liste_err): ### Tracé pour de bon if l_jours != []: - ax.plot(l_jours_conv,l_poids,label=conf["nom"],color=conf["couleurs"]["cadretxt"],marker='o') + print(conf["symbole"]) + ax.plot(l_jours_conv,l_poids,label=conf["nom"],color=conf["couleurs"]["courbeenfant"],marker=conf["symbole"]) debug("Tracé de la courbe enfant, avec les jours "+str(l_jours_conv),liste_err) + + + listenoms = [] + if conf["nom"] != "": # Ajouter le nom de l'enfant + listenoms.append(conf["nom"]) + +# if enfants_add != []: +# debug("Il y a des enfants en plus à tracer. Données : "+str(enfants_add), liste_err) + for enfant in enfants_add: # Enfants additionnels éventuels + conf_add, lj, ld = enfant[typedonnee] # On récuère les données + if lj != []: # pas la peine de tracer si y'a rien à tracer + # Ajouter le nom de cet enfant-là + listenoms.append(conf_add["nom"]) + # Le mot "courbe" doit être au pluriel du coup ! + titre = titre.replace("Courbe ", "Courbes ") + lj_conv = u.convertit_tableau(lj,unite,liste_err) + debug("Tracé de la courbe additionnelle de "+conf_add["nom"]+" config : "+str(conf_add), liste_err) + ax.plot(lj_conv, ld, label=conf_add["nom"], color=conf_add["couleurcourbe"],marker=conf_add["symbole"]) + + if conf["sexe"] != conf_add["sexe"]: + warning("Attention, tous les enfants n'ont pas le même sexe. La courbe de référence est celle de "+conf["nom"]+" et ne sera pas forcément pertinente pour les autres. Vous pouvez éventuellement essayer la courbe neutre. Remarque : cette alerte s'affichera quand même.", liste_err) + + + # Si y'a un nom on met "courbe de machin, de bidule, d'alala, de truc" + for i in range(len(listenoms)): + # Mot de liaison : , ou et ? + if i>0 and i!=len(listenoms)-1: + titre += ", " + elif i>0 and i == len(listenoms) -1: + titre+= " et " + else: + titre += " " + # Est-ce que la première lettre est une voyelle ? + lettre = simplifie_nom(listenoms[i]).lower()[0] + if lettre in CONFIG["voyelles"]: + titre += "d'" + else: + titre += "de " + titre += listenoms[i] + + if prema>0: + titre+= ", préma de "+conf["prematurite"] + if conf["agecorrige"] == "oui": + titre+=" (courbe en âge corrigé)" + else: + titre+=" (courbe en âge réel, données OMS décalées)" #### extrapolatios éventuelles # a-t-on demndé des calculs ? jextrapole = conf["non_sauve"]["prolongercourbes"] == "oui" # Est-ce qu'on a demandé un calcul sur cette donnée ? - print() + for calextra in CONFIG["extradata"]: jextrapole = jextrapole or conf["non_sauve"][calextra+"_type"] == typedonnee @@ -195,7 +244,11 @@ def cree_figure(conf,l_jours,l_poids,typedonnee,liste_extracalculs, liste_err): # On va prendre les extrapolations de la dernière donnée jusqu'à l fin du graphe debut_extr = int(l_jours[-conf["non_sauve"]["nbextradata"]]) i_debut_extr = dates_extrapole.index(debut_extr) - i_fin_extr = dates_extrapole.index(jour_maxi) + if jour_maxi >= dates_extrapole[-1]: + i_fin_extr = len(dates_extrapole) -1 + else: + i_fin_extr = dates_extrapole.index(jour_maxi) + print("bla", i_debut_extr, i_fin_extr) # Voilà ce qu'on veut tracer dates_extrapole_trace = dates_extrapole[i_debut_extr:i_fin_extr+1] donnees_extrapole_trace = donnees_extrapole[i_debut_extr:i_fin_extr+1] @@ -213,18 +266,14 @@ def cree_figure(conf,l_jours,l_poids,typedonnee,liste_extracalculs, liste_err): # ça sera donc une extrapolation r = calcule_donnee_extrapolee(dates_extrapole, donnees_extrapole, conf["non_sauve"]["calculextradata_age"], liste_err) message=formate_extrapole(conf["non_sauve"]["nbextradata"]) -# if == 0: -# message+="l'ensemble des données" -# else: -# message+="les "+str(conf["non_sauve"]["nbextradata"])+" dernière"+met_s(conf["non_sauve"]["nbextradata"])+" données" else: message=formate_interpole() - texte = formate_resultat_donnee(conf["non_sauve"]["calculextradata_age"], r, typedonnee, message, liste_err) + texte = formate_resultat_donnee(conf["non_sauve"]["calculextradata_age"], conf["non_sauve"]["calculextradata_date"], r, typedonnee, message, liste_err) debug("calcul de la donnée extrapolée : "+texte, liste_err) if texte!="": liste_extracalculs.append(texte) - print(liste_extracalculs) + #print(liste_extracalculs) # Ajouter le trait ? if conf["non_sauve"]["calculextradata_trace"] == "oui": dessine_guides(conf["non_sauve"]["calculextradata_age"], r, conf["couleurs"]["cadretxt"], unite, ax, liste_err) @@ -233,14 +282,23 @@ def cree_figure(conf,l_jours,l_poids,typedonnee,liste_extracalculs, liste_err): if conf["non_sauve"]["calculextratemps_type"] == typedonnee: # interpolation r = interpole_lineaire_ordonnee(l_jours,l_poids,conf["non_sauve"]["calculextratemps_val"], liste_err) + if type(conf["naissance"]) == datetime.date: + rdate = conf["naissance"] + datetime.timedelta(days=r) + else: + rdate = None + if r==-1: # ça sera donc une extrapolation - r = calcule_age_extrapole(dates_extrapole, donnees_extrapole, conf["non_sauve"]["calculextratemps_val"], liste_err) + r = calcule_age_extrapole(dates_extrapole, donnees_extrapole, conf["non_sauve"]["calculextratemps_val"], liste_err) + if type(conf["naissance"]) == datetime.date: + rdate = conf["naissance"] + datetime.timedelta(days=round(r)) + else: + rdate = None message=formate_extrapole(conf["non_sauve"]["nbextradata"]) else: message=formate_interpole() - - texte = formate_resultat_age(r, conf["non_sauve"]["calculextratemps_val"], typedonnee, message, liste_err) + print(r, rdate) + texte = formate_resultat_age(r, rdate, conf["non_sauve"]["calculextratemps_val"], typedonnee, message, liste_err) #r = calcule_age_extrapole(dates_extrapole, donnees_extrapole, conf["non_sauve"]["calculextratemps_val"], typedonnee, liste_err) if texte!="": @@ -281,6 +339,30 @@ def cree_figure(conf,l_jours,l_poids,typedonnee,liste_extracalculs, liste_err): poids_max = poids_max * 1.05 + + ### Repères additionnels éventuels. + #reperes est une liste qui contient des dictionnaires avec "typed" (type de donnée : âge, etc), "donnee" : + #la donnée (en jours pour l'âge), et "texte": le texte à mettre sur le repère en question. + #Pour tracer des repères verticaux (horizontaux plus tard) sur la courbe. + + debug("Échelle ok. Voir s'il y a des repères supplémentaires : "+str(conf["liste_reperes"]), liste_err) + + for rep in conf["liste_reperes"]: + if rep.get("trace", "") == "oui": # SI on veut tracer + agec = u.convertitunite(rep["donnee"], unite, liste_err) + # Tracé de la ligne verticale + ax.vlines(agec, poids_min, poids_max, linestyles="dashed", color=conf["couleurs"]["cadretxt"]) + # date à afficher ? + if rep["affichedate"] == "oui" and rep["date"] != "": + ax.text(agec, poids_min,rep["date"]+" ", rotation=90, verticalalignment='top', horizontalalignment='center', color=conf["couleurs"]["cadretxt"], fontstyle="italic") + # Si y'a un texte à afficher + if rep["texte"] != "": + ax.text(agec, poids_min, " "+rep["texte"], rotation=90, verticalalignment='bottom', horizontalalignment='right', color=conf["couleurs"]["cadretxt"]) + + + + + # Grille custom ? if conf["non_sauve"]["grilleamelio"] == "oui": debug("On a choisi la grille plus jolie", liste_err) @@ -298,14 +380,19 @@ def cree_figure(conf,l_jours,l_poids,typedonnee,liste_extracalculs, liste_err): ax.set_yticks(echellemajeure, minor=False) ax.set_yticks(echellemineure, minor=True) - # échelle en temps - pas=u.choix_echelle_temps(unite, age_maxi) + + # Le jour minimum n'est pas forcément zéro ! + age_mini = min(l_jours[0], 0) + + pas=u.choix_echelle_temps(unite, age_maxi - age_mini) debug("pas choisis pour l'échelle en x : "+str(pas), liste_err) + + - echellemajeure = arange(0,age_maxi, pas[0]) + echellemajeure = arange(age_mini,age_maxi, pas[0]) if pas[1] >0: - echellemineure = arange(0,age_maxi, pas[1]) + echellemineure = arange(age_mini,age_maxi, pas[1]) else: echellemineure = [] ax.set_xticks(echellemajeure, minor=False)