X-Git-Url: https://git.immae.eu/?p=perso%2FDenise%2Foms.git;a=blobdiff_plain;f=trace_courbe.py;h=e72560782e47f9268694400bcab791cadcd0c40e;hp=9cb4845c658c63191caaf39e49546f7ff63704fd;hb=cf0d4c8c36224ca7059e99d03c25abaf694011d7;hpb=685a5f75f63d483d09a593ec69efad882a63a34e

diff --git a/trace_courbe.py b/trace_courbe.py
index 9cb4845..e725607 100644
--- a/trace_courbe.py
+++ b/trace_courbe.py
@@ -1,29 +1,37 @@
 #!/usr/bin/env python3
 # -*- coding: utf-8 -*-
 from configuration import CONFIG
-from gestionOMS import *
-from gestion_unites import *
-from gestion_donnees import calcule_max_graphique, convertit_jours_vers_python
+import gestionOMS as oms
+import gestion_unites as u
+from gestion_donnees import calcule_max_graphique, convertit_jours_vers_python, convertit_age_vers_texte
+from gestion_erreurs import debug, erreur, warning
 from numpy import arange
+from calculs_extrapole import calcule_donnee_extrapolee, calcule_age_extrapole
 
 import matplotlib.pyplot as plt
 
-# Essentiellement, la fonction qui trace la courbe
+# Essentiellement, la fonction qui trace la courbe, mais on y trouve également les fonctions d'extrapolation.
+# Ainsi que les calculs additionnels.
 
 
-def cree_figure(conf,l_jours,l_poids,typedonnee,liste_err):
-    debug("debut de cree_figure",liste_err)
+def cree_figure(conf,l_jours,l_poids,typedonnee,liste_extracalculs, liste_err):
+    """ conf est le dictionnaire de config. l_jours et l_poids les listes des temps (en jours) et de données
+    (donc pas forcément du poids)
+    typedonnee est le type de données (voir CONFIG["liste_typedonnees"]
+    liste_err la liste des erreurs à compléter (voir gestion_erreurs))
+    Renvoie la figure tracée, et les calculs additionnels sont mis sous forme de chaîne dans la liste
+    liste_extracalculs"""
+    debug("debut de cree_figure. Config : "+str(conf),liste_err)
     try:
-        liste_data_labels_p,liste_data_labels_z = renvoie_liste_labels(conf,CONFIG["liste_data_choisie_p"],CONFIG["liste_data_choisie_z"],liste_err)
+        liste_data_labels_p,liste_data_labels_z = oms.renvoie_liste_labels(conf,CONFIG["liste_data_choisie_p"],CONFIG["liste_data_choisie_z"],liste_err)
     except:
         erreur("bug avec liste data labels",liste_err)
         return ""
 
-    # maxi saisi par l'utilisateur ?
+    ######################## Gestion des bornes #############################
+    # y a-t-il un maxi saisi par l'utilisateur ?
     if conf["maxi"] ==0:
         # Est-ce qu'on a donné un maxi quand même (car même échelle) ?
-        print(conf)
-        print(conf["non_sauve"])
         if conf["non_sauve"].get("maxi",0) == 0:
             jour_maxi = calcule_max_graphique(l_jours)
         else:
@@ -31,42 +39,41 @@ def cree_figure(conf,l_jours,l_poids,typedonnee,liste_err):
     else:
         jour_maxi = conf["maxi"]+1
         
-
     # On s'assure que c'est bien compris dans les bornes
     jour_maxi = max(CONFIG["jours_mini_courbe"],min(jour_maxi,CONFIG["jours_maxi_courbe"]))
-    debug("cree_figure : gestion du jour max ok : "+str(jour_maxi),liste_err)    
+    debug("cree_figure : gestion du jour max : "+str(jour_maxi),liste_err)    
     
+    ##################### Gestion des unités ###############################
     # si l'unité n'est pas précisée, ni en "non sauvé" ni par l'utilisateur
     if conf["unite"] == "" and conf["non_sauve"].get("unite","") == "":
-        unite = choix_unite(jour_maxi)
+        unite = u.choix_unite(jour_maxi)
         debug("Unité non précisée, on choisit "+unite,liste_err)
     elif conf["unite"] != "":
         unite = conf["unite"]
     else:
         unite = conf["non_sauve"]["unite"]
     
-    #debug("prématurité dans la config : "+conf["prematurite"],liste_err)
+    ##################### Gestion de la prématurité #######################"
     prema = int(convertit_jours_vers_python(conf["prematurite"],liste_err))
     ## Gestion des prémas, deux cas :
     # Si agecorrige est oui, alors on veut juste soustraire la valeur de préma
     # à toutes les données.
     # Si agecorrige est non, alors on veut ajouter la valeur de préma aux courbes de référence.
-
-    debug("Prématurité : "+str(prema)+" age corrigé : "+conf["agecorrige"],liste_err)
-            
+    debug("Prématurité : "+str(prema)+" age corrigé : "+conf["agecorrige"],liste_err)           
     if prema>0 and conf["agecorrige"] == "oui":
         l_jours = [j-prema for j in l_jours]
         jour_maxi = jour_maxi - prema
-#        debug("liste des jours : "+str(l_jours),liste_err)
 
-    l_jours_conv = convertit_tableau(l_jours,unite,liste_err)
+
+    ###################### Conversion des unités ###########################""
+    l_jours_conv = u.convertit_tableau(l_jours,unite,liste_err)
     # Attention, comme les jours commencent à partir de 0, faut enlever 1 pour avoir la borne...
-    age_maxi = convertitunite(jour_maxi-1,unite,liste_err)
+    age_maxi = u.convertitunite(jour_maxi-1,unite,liste_err)
     
     debug("cree_figure : conversion des unités ok : "+str(l_jours_conv),liste_err)        
 
+    #####################" Courbes OMS  et titre ######################################"
     titre = "Courbe de "+typedonnee+" OMS"
-    
     if conf["typecourbe"] == "P":
         # percentiles
         liste_data_labels = liste_data_labels_p
@@ -98,7 +105,6 @@ def cree_figure(conf,l_jours,l_poids,typedonnee,liste_err):
     if conf["nom"] !="":
         titre += " de " +conf["nom"]
 
-    
     if prema>0:
         titre+= ", préma de "+conf["prematurite"]
         if conf["agecorrige"] == "oui":
@@ -106,30 +112,28 @@ def cree_figure(conf,l_jours,l_poids,typedonnee,liste_err):
         else:
             titre+=" (courbe en âge réel, données OMS décalées)"
    
-    debug("cree_figure : géré le type de courbe ok. Liste des data labels : "+str(liste_data_labels),liste_err)
+    #debug("cree_figure : géré le type de courbe ok. Liste des data labels : "+str(liste_data_labels),liste_err)
     debug("Fichier d'où extraire les données : "+fichier_oms,liste_err)
+ 
     
-        
-    
-    # convertir les unités
-    #### Partie code OMS
     #### On extrait les données des courbes, et on convertit les jours dans l'unité voulues
     try:
-        t = lire_fichier_csv(fichier_oms)
+        t = oms.lire_fichier_csv(fichier_oms)
     except:
-        liste_err[0].append("Impossible d'ouvrir le fichier "+fichier_oms)
+        erreur("cree_figure : Impossible d'ouvrir le fichier "+fichier_oms, liste_err)
         return ""
     
-    debug("cree_figure : on va convertir données OMS à la bonne unité",liste_err)
+    debug("cree_figure : Conversion des données OMS à la bonne unité",liste_err)
     try:
-        coljour= (extraire_colonne(t,0,jour_maxi))
+        coljour= (oms.extraire_colonne(t,0,jour_maxi))
         if prema>0 and conf["agecorrige"] != "oui":
             coljour = [j + prema for j in coljour]
-        coljour = convertit_tableau(coljour,unite,liste_err)
+        coljour = u.convertit_tableau(coljour,unite,liste_err)
     except:
         erreur("Problème à la conversion du tableau OMS. jour_maxi = "+str(jour_maxi)+" unite = "+unite,liste_err)
         return ""
     
+    ##################### Création de la figure et du graphique ###################
     debug("cree_figure : prête à créer la figure",liste_err)   
     #### La figure, params
     
@@ -142,64 +146,110 @@ def cree_figure(conf,l_jours,l_poids,typedonnee,liste_err):
     plt.rcParams['legend.edgecolor'] = conf["couleurs"]["grille"]
     ax = plt.axes() 
 
+    ###################### Tracé des différentes courbes
     #Tracé des courbes OMS
     for (i,label,couleur) in liste_data_labels:
-        ax.plot(coljour,extraire_colonne(t,i,jour_maxi),label=label,color=couleur)
-        #warning("colonne"+str(i)+str(label)+str(couleur),liste_err)
+        ax.plot(coljour,oms.extraire_colonne(t,i,jour_maxi),label=label,color=couleur)
 
     debug("cree_figure : tracé des courbes OMS ok",liste_err) 
-    
-    
-    ##### Tracé des courbes OMS fini
-    
-    # On extrait la valeur min et la valeur max des poids
-    (colonne_min,_,_) = liste_data_labels[-1]
-    (colonne_max,_,_) = liste_data_labels[0]
-    
-    debug("cree_figure : colonnes min et max : "+str(colonne_min)+" "+str(colonne_max),liste_err)
-    
-    poids_min = min(extraire_colonne(t,colonne_min,jour_maxi))
-    poids_max = max(extraire_colonne(t,colonne_max,jour_maxi))
-    if l_jours != []:
-        poids_min = min(min(l_poids),poids_min)
-        poids_max = max(max(l_poids),poids_max)
-    # On ajuste un peu ces min et max
-    # min : valeur min -1kg
-    poids_min = max(0,poids_min-1)
-    #max : +5% 
-    poids_max = poids_max * 1.05
-       
-    
-    debug("cree_figure : prête à tracer la courbe de l'enfant",liste_err)
-
+        
     ### Tracé pour de bon    
     if l_jours != []:
         ax.plot(l_jours_conv,l_poids,label=conf["nom"],color=conf["couleurs"]["cadretxt"],marker='o')
         debug("Tracé de la courbe enfant, avec les jours "+str(l_jours_conv),liste_err)
         
         #### extrapolatios éventuelles
-        #print("prolongercourbes" in conf)
-        if conf["prolongercourbes"] == "oui":
-            #print("coucou")
-            # les dates, on prend tous les jours tant qu'à faire
-            date_fin = int(l_jours[-1])
-            dates_extrapole = list(range(date_fin, jour_maxi))
-            donnees_extrapole =  prolongecourbe(t, date_fin, l_poids[-1], dates_extrapole, conf["typecourbe"], liste_err)
-            #print("données extrapolées !")
-            dates_extrapole = convertit_tableau(dates_extrapole,unite,liste_err)
-            
-            # tracé des données extrapolées
-            plt.plot(dates_extrapole, donnees_extrapole,color=conf["couleurs"]["cadretxt"], linestyle=(0, (5,7)), marker=None)
+        # a-t-on demndé des calculs ?
+        jextrapole =  conf["non_sauve"]["prolongercourbes"] == "oui"
+        # Est-ce qu'on a demandé un calcul sur cette donnée ?
+        print()
+        for calextra in CONFIG["extradata"]:
+            jextrapole = jextrapole or conf["non_sauve"][calextra+"_type"] == typedonnee
+        
+        #print(jextrapole)
+        if jextrapole:
+            try:
+                debug("Il faut extrapoler les courbes !", liste_err)
+                # Prendre l'ensemble des dates "source"
+    #            print(conf["non_sauve"]["nbdataextra"])
+                if conf["non_sauve"]["nbextradata"] == 0:
+                    sources_extrap = l_jours
+                    sources_extrap_data = l_poids
+                else:
+                    sources_extrap = l_jours[-conf["non_sauve"]["nbextradata"]:] # les derniers jours
+                    sources_extrap_data = l_poids[-conf["non_sauve"]["nbextradata"]:]
+                
+                debug("On extrapole sur les jours : "+str(sources_extrap), liste_err)
+               
+                dates_extrapole, donnees_extrapole =  prolongecourbe(t, sources_extrap, sources_extrap_data, conf["typecourbe"], liste_err)
+                debug("données extrapolées !", liste_err)
+                #debug(str(dates_extrapole[0:10])+str(donnees_extrapole[0:10]), liste_err)            
+                
+                # QUe veut-on maintenant sur ces données extrapolées ?
+                # Afficher la courbe
+                if conf["non_sauve"]["prolongercourbes"] == "oui":
+                    # On va prendre les extrapolations de la dernière donnée jusqu'à l fin du graphe
+                    debut_extr = int(l_jours[-conf["non_sauve"]["nbextradata"]])
+                    i_debut_extr = dates_extrapole.index(debut_extr)
+                    i_fin_extr = dates_extrapole.index(jour_maxi)
+                    # Voilà ce qu'on veut tracer
+                    dates_extrapole_trace = dates_extrapole[i_debut_extr:i_fin_extr+1]
+                    donnees_extrapole_trace = donnees_extrapole[i_debut_extr:i_fin_extr+1]                
+                    dates_extrapole_trace = u.convertit_tableau(dates_extrapole_trace,unite,liste_err)
+                    
+                    # tracé des données extrapolées
+                    plt.plot(dates_extrapole_trace, donnees_extrapole_trace,color=conf["couleurs"]["cadretxt"], linestyle=(0, (5,7)), marker=None)
+                    debug("Tracé de la courbe extrapolée ok", liste_err)
+                
+                # Calculer une donnée à l'âge x
+                if conf["non_sauve"]["calculextradata_type"] == typedonnee:
+                    r = calcule_donnee_extrapolee(dates_extrapole, donnees_extrapole, conf["non_sauve"]["calculextradata_age"], typedonnee, liste_err)
+                    if r!="":
+                        liste_extracalculs.append(r)
+                        print(liste_extracalculs)
+                        
+                # Calculer un âge où on atteint cette donnée
+                if conf["non_sauve"]["calculextratemps_type"] == typedonnee:
+                    r = calcule_age_extrapole(dates_extrapole, donnees_extrapole, conf["non_sauve"]["calculextratemps_val"], typedonnee, liste_err)
+                    if r!="":
+                        liste_extracalculs.append(r)
+                        print(liste_extracalculs)
+                    
+            except: 
+                warning("Des problèmes pour extrapoler...", liste_err)
         
     else:
         debug("On ne trace pas de courbe enfant", liste_err)
 
-    debug("Début de la gestion de l'échelle", liste_err)
+    ###################" Gestion de l'échelle #####################
+    debug("Courbes tracées. Il n'y a plus qu'à gérer l'échelle", liste_err)
     ### échelle à régler
+
+    # On extrait la valeur min et la valeur max des poids des courbes OMS et des données
+    (colonne_min,_,_) = liste_data_labels[-1]
+    (colonne_max,_,_) = liste_data_labels[0]
     
+    # poids max OMS
+    poids_min = min(oms.extraire_colonne(t,colonne_min,jour_maxi))
+    poids_max = max(oms.extraire_colonne(t,colonne_max,jour_maxi))
+    if l_jours != []:
+        poids_min = min(min(l_poids),poids_min)
+        # Pour le poids max, voir la dernière valeur du tableau
+        i = 0
+        while i<len(l_jours) and l_jours[i]<jour_maxi:
+            i=i+1
+        poids_max = max(max(l_poids[0:i+1]),poids_max)
+    # On ajuste un peu ces min et max
+    # min : valeur min -1kg
+    poids_min = max(0,poids_min-1)
+    #max : +5% 
+    poids_max = poids_max * 1.05
+       
+
+    # Grille custom ?
     if conf["non_sauve"]["grilleamelio"] == "oui":
-    
-        pas=choix_echelle_data(typedonnee, poids_max)
+        debug("On a choisi la grille plus jolie", liste_err)
+        pas=u.choix_echelle_data(typedonnee, poids_max)
         # data_min_arrondie
         minechelle = int(poids_min/pas[0])*pas[0]
     
@@ -215,7 +265,7 @@ def cree_figure(conf,l_jours,l_poids,typedonnee,liste_err):
         ax.set_yticks(echellemineure, minor=True)
     
         # échelle en temps
-        pas=choix_echelle_temps(unite, age_maxi)
+        pas=u.choix_echelle_temps(unite, age_maxi)
         debug("pas choisis pour l'échelle en x : "+str(pas), liste_err)    
     
         echellemajeure = arange(0,age_maxi, pas[0])
@@ -226,8 +276,7 @@ def cree_figure(conf,l_jours,l_poids,typedonnee,liste_err):
         ax.set_xticks(echellemajeure, minor=False)
         ax.set_xticks(echellemineure, minor=True)    
 
-
-    #### Aspect du graphique
+    ################################# Aspect du graphique
 
     debug("On commende la déco du graphique", liste_err)
 
@@ -238,14 +287,11 @@ def cree_figure(conf,l_jours,l_poids,typedonnee,liste_err):
 
     plt.xlabel("Âge en "+unite,color=conf["couleurs"]["cadretxt"])
     plt.ylabel(typedonnee.capitalize()+" en "+CONFIG["unites_typedonnees"][typedonnee],color=conf["couleurs"]["cadretxt"])
-    #print("bla")
     plt.title(titre,color=conf["couleurs"]["cadretxt"])
-    #print("ble")
     if l_jours_conv == []:
         plt.axis([0,age_maxi, poids_min, poids_max])
     else:
         plt.axis([min(0,l_jours_conv[0]),age_maxi,poids_min,poids_max])
-    #print("bli")
 
     
     if conf['legende']=="oui":
@@ -255,53 +301,74 @@ def cree_figure(conf,l_jours,l_poids,typedonnee,liste_err):
 
     fig.tight_layout()
     
-    debug("Fin de cree_figure", liste_err)
+    debug("Fin de cree_figure, tout va bien.", liste_err)
     return fig
 
 
 
 
-### Pour extrapoler la courbe
+######################################## Pour extrapoler la courbe
 
-def prolongecourbe(tableauOMS, date, donnee, nouvdates, typecourbe, liste_err):
-    """ tableauOMS est le ableau des données OMS. date et donnee sont la date (jours)
-    et la dernière donnée d'où on extrapole. On veut les extrapolations à nouvdate 
+def prolongecourbe(tableauOMS, dates, donnees, typecourbe, liste_err):
+    """ tableauOMS est le ableau des données OMS. dates et donnees sont les dates (jours)
+    et les données d'où on extrapole. On calcule toutes les dates comme des sauvages.
+    On renvoie la liste des jours totale et la liste des data_totales
     (tableaux de jours)
     typecourbe est P ou Z. Pour P il faut commencer à regarder à l'indice 4, pour Z
     à l'indice 1
-    On renvoie [] si pas pu extrapoler. """
+    On renvoie [],[] si pas pu extrapoler. """    
+    # les lignes OMS correspondant aux dates données
+    lignesoms = [tableauOMS[int(date)] for date in dates]
+    debug("prolongecourbe : Lignes OMS :"+str(lignesoms)+" valeur de données : "+str(donnees), liste_err)
     
-    # la ligne OMS
-    ligneoms = tableauOMS[date]
-    debug("prolongecourbe : Ligne OMS :"+str(ligneoms)+" valeur de donnée : "+str(donnee), liste_err)
     
     
-    # On cherche dans quel intervalle on se situe
+    # Principe : on cherche dans quel intervalle de "colonnes" on se situe.
+    # On va donc regarder pour chaque donnée entre quels i on se situe,et après
+    # prendre le plus grand intervalle.
+    # Numéros de colonnes d'où on part. Pour la fin c'est forcément longueur-1
     if typecourbe == "P":
         idep=4
     else:
         idep = 1
-    i = idep
-    while i<len(ligneoms) and ligneoms[i]<donnee:
-        i+=1
-    debug("prolongecourbe : on a trouvé la valeur de i : "+str(i),liste_err)
-    if i>=len(ligneoms):
-        warning("prolongation de courbe : pas réussi... donnée au dessus !", liste_err)
-        return []
-    if i==idep:
-        warning("prolongation de courbe : pas réussi... donnée en dessous !", liste_err)
-        return []
+
+    liste_indices = []
+    for k in range(len(dates)):
+        i= idep
+        ligne = lignesoms[k]
+        while i<len(ligne) and ligne[i]<donnees[k]:
+            i+=1
+        debug("prolongecourbe : on a trouvé la valeur de i : "+str(i),liste_err)
+        if i>=len(ligne):
+            warning("prolongation de courbe : pas réussi... donnée trop haute !", liste_err)
+            return [],[]
+        if i==idep:
+            warning("prolongation de courbe : pas réussi... donnée trop basse !", liste_err)
+            return [],[]
+        liste_indices.append(i)
+    imin=min(liste_indices) -1
+    imax=max(liste_indices)
+    debug("Les données se situent dans les indices : "+str(imin)+", "+str(imax),liste_err)
+    # Maintenant on doit trouver les coeffs : on se situe en coeff * l[imin]+ (1-coeff)*ligne[imax]
+    # Et faire la moyenne de ces coeffs
+    total = 0
+    for k in range(len(dates)):
+        ligne = lignesoms[k]
+        donnee = donnees[k]
+        total += (donnee - ligne[imax])/(ligne[imin] - ligne[imax])
+        #print(k)        
+    coeff_moyen = total/len(dates)
+
+    debug("Coeff moyen calculé : "+str(coeff_moyen), liste_err)
     
-    # Le coeff : donnee = coeff * l[i-1]+ (1-coeff)*ligne[i]
-    # On utilisera la même chose pour la nouvelle donnee
-    #print(ligneoms[i], ligneoms[i-1])
-    coeff = (donnee - ligneoms[i])/(ligneoms[i-1] - ligneoms[i])
-    #print("coeff : "+str(coeff))
+    # On utilisera la même chose pour les nouvelle donnee
     
     # extrapolations
+    nouvdates =oms.extraire_colonne(tableauOMS,0) # On sort tout.
+    #print(nouvdates)
     nouvdonnees = []
     for j in nouvdates:
-        ligne2 = tableauOMS[j]
-        nouvdonnees.append(coeff*ligne2[i-1]+ (1-coeff)*ligne2[i])
+        ligne2 = tableauOMS[int(j)]
+        nouvdonnees.append(coeff_moyen*ligne2[imin]+ (1-coeff_moyen)*ligne2[imax])
 
-    return nouvdonnees
\ No newline at end of file
+    return nouvdates,nouvdonnees
\ No newline at end of file