X-Git-Url: https://git.immae.eu/?p=perso%2FDenise%2Foms.git;a=blobdiff_plain;f=trace_courbe.py;h=c39f2657b9c15217cd5cc167407b4639ca7e3ca0;hp=e72560782e47f9268694400bcab791cadcd0c40e;hb=9d7f1506a59fdda338491f6df8c1e5bd2e442ab8;hpb=cf0d4c8c36224ca7059e99d03c25abaf694011d7 diff --git a/trace_courbe.py b/trace_courbe.py index e725607..c39f265 100644 --- a/trace_courbe.py +++ b/trace_courbe.py @@ -3,10 +3,12 @@ from configuration import CONFIG import gestionOMS as oms import gestion_unites as u -from gestion_donnees import calcule_max_graphique, convertit_jours_vers_python, convertit_age_vers_texte +from gestion_donnees import calcule_max_graphique, convertit_jours_vers_python from gestion_erreurs import debug, erreur, warning +from calculs_extrapole import calcule_donnee_extrapolee, calcule_age_extrapole, interpole_lineaire, interpole_lineaire_ordonnee, formate_resultat_donnee, formate_resultat_age, formate_interpole, formate_extrapole + from numpy import arange -from calculs_extrapole import calcule_donnee_extrapolee, calcule_age_extrapole + import matplotlib.pyplot as plt @@ -14,14 +16,19 @@ import matplotlib.pyplot as plt # Ainsi que les calculs additionnels. -def cree_figure(conf,l_jours,l_poids,typedonnee,liste_extracalculs, liste_err): +def cree_figure(conf,l_jours,l_poids,typedonnee,liste_extracalculs, liste_err, enfants_add = []): """ conf est le dictionnaire de config. l_jours et l_poids les listes des temps (en jours) et de données (donc pas forcément du poids) typedonnee est le type de données (voir CONFIG["liste_typedonnees"] liste_err la liste des erreurs à compléter (voir gestion_erreurs)) Renvoie la figure tracée, et les calculs additionnels sont mis sous forme de chaîne dans la liste - liste_extracalculs""" - debug("debut de cree_figure. Config : "+str(conf),liste_err) + liste_extracalculs + + Les enfants en plus sont dans la liste enfants_add. Pour chaque item de la liste, il faut prendre + item[typed] pour avoir accès au nom, ljours, et ldonnees + + """ + debug("debut de cree_figure. Config : "+str(conf)+". Nombre d'enfants additionnels : "+str(len(enfants_add)),liste_err) try: liste_data_labels_p,liste_data_labels_z = oms.renvoie_liste_labels(conf,CONFIG["liste_data_choisie_p"],CONFIG["liste_data_choisie_z"],liste_err) except: @@ -38,6 +45,10 @@ def cree_figure(conf,l_jours,l_poids,typedonnee,liste_extracalculs, liste_err): jour_maxi = conf["non_sauve"]["maxi"]+1 else: jour_maxi = conf["maxi"]+1 + + # Si on cherche à extrapoler au-delà + if conf["non_sauve"]["calculextradata_type"] == typedonnee and conf["non_sauve"]["calculextradata_age"]>jour_maxi: + jour_maxi = int(conf["non_sauve"]["calculextradata_age"]) +1 # On s'assure que c'est bien compris dans les bornes jour_maxi = max(CONFIG["jours_mini_courbe"],min(jour_maxi,CONFIG["jours_maxi_courbe"])) @@ -101,16 +112,7 @@ def cree_figure(conf,l_jours,l_poids,typedonnee,liste_extracalculs, liste_err): erreur("Type de courbe invalide"+conf["typecourbe"],liste_err) return "" - # Si y'a un nom on met "courbe de machin" - if conf["nom"] !="": - titre += " de " +conf["nom"] - - if prema>0: - titre+= ", préma de "+conf["prematurite"] - if conf["agecorrige"] == "oui": - titre+=" (courbe en âge corrigé)" - else: - titre+=" (courbe en âge réel, données OMS décalées)" + ## On finira le titre plus tard quand on aura su qui est concerné #debug("cree_figure : géré le type de courbe ok. Liste des data labels : "+str(liste_data_labels),liste_err) debug("Fichier d'où extraire les données : "+fichier_oms,liste_err) @@ -155,18 +157,51 @@ def cree_figure(conf,l_jours,l_poids,typedonnee,liste_extracalculs, liste_err): ### Tracé pour de bon if l_jours != []: - ax.plot(l_jours_conv,l_poids,label=conf["nom"],color=conf["couleurs"]["cadretxt"],marker='o') + print(conf["symbole"]) + ax.plot(l_jours_conv,l_poids,label=conf["nom"],color=conf["couleurs"]["courbeenfant"],marker=conf["symbole"]) debug("Tracé de la courbe enfant, avec les jours "+str(l_jours_conv),liste_err) + + + listenoms = [] + if conf["nom"] != "": # Ajouter le nom de l'enfant + listenoms.append(conf["nom"]) + +# if enfants_add != []: +# debug("Il y a des enfants en plus à tracer. Données : "+str(enfants_add), liste_err) + for enfant in enfants_add: # Enfants additionnels éventuels + conf_add, lj, ld = enfant[typedonnee] # On récuère les données + if lj != []: # pas la peine de tracer si y'a rien à tracer + # Ajouter le nom de cet enfant-là + listenoms.append(conf_add["nom"]) + lj_conv = u.convertit_tableau(lj,unite,liste_err) + debug("Tracé de la courbe additionnelle de "+conf_add["nom"]+" config : "+str(conf_add), liste_err) + ax.plot(lj_conv, ld, label=conf_add["nom"], color=conf_add["couleurcourbe"],marker=conf_add["symbole"]) + + if conf["sexe"] != conf_add["sexe"]: + warning("Attention, tous les enfants n'ont pas le même sexe. La courbe de référence est celle de "+conf["nom"]+" et ne sera pas forcément pertinente pour les autres. Vous pouvez éventuellement essayer la courbe neutre. Remarque : cette alerte s'affichera quand même.", liste_err) + + + # Si y'a un nom on met "courbe de machin" + if listenoms != []: + titre += " de " +", ".join(listenoms) + + if prema>0: + titre+= ", préma de "+conf["prematurite"] + if conf["agecorrige"] == "oui": + titre+=" (courbe en âge corrigé)" + else: + titre+=" (courbe en âge réel, données OMS décalées)" #### extrapolatios éventuelles # a-t-on demndé des calculs ? jextrapole = conf["non_sauve"]["prolongercourbes"] == "oui" # Est-ce qu'on a demandé un calcul sur cette donnée ? - print() + for calextra in CONFIG["extradata"]: jextrapole = jextrapole or conf["non_sauve"][calextra+"_type"] == typedonnee #print(jextrapole) + ############################## Là où on extrapole ################################ if jextrapole: try: debug("Il faut extrapoler les courbes !", liste_err) @@ -181,6 +216,7 @@ def cree_figure(conf,l_jours,l_poids,typedonnee,liste_extracalculs, liste_err): debug("On extrapole sur les jours : "+str(sources_extrap), liste_err) + # On récupère toutes les données extrapolées dates_extrapole, donnees_extrapole = prolongecourbe(t, sources_extrap, sources_extrap_data, conf["typecourbe"], liste_err) debug("données extrapolées !", liste_err) #debug(str(dates_extrapole[0:10])+str(donnees_extrapole[0:10]), liste_err) @@ -201,19 +237,46 @@ def cree_figure(conf,l_jours,l_poids,typedonnee,liste_extracalculs, liste_err): plt.plot(dates_extrapole_trace, donnees_extrapole_trace,color=conf["couleurs"]["cadretxt"], linestyle=(0, (5,7)), marker=None) debug("Tracé de la courbe extrapolée ok", liste_err) - # Calculer une donnée à l'âge x + ### Calculer une donnée à l'âge x if conf["non_sauve"]["calculextradata_type"] == typedonnee: - r = calcule_donnee_extrapolee(dates_extrapole, donnees_extrapole, conf["non_sauve"]["calculextradata_age"], typedonnee, liste_err) - if r!="": - liste_extracalculs.append(r) + # On essaie l'interpolation + r = interpole_lineaire(l_jours,l_poids,conf["non_sauve"]["calculextradata_age"], liste_err) + if r==-1: + # ça sera donc une extrapolation + r = calcule_donnee_extrapolee(dates_extrapole, donnees_extrapole, conf["non_sauve"]["calculextradata_age"], liste_err) + message=formate_extrapole(conf["non_sauve"]["nbextradata"]) + else: + message=formate_interpole() + + texte = formate_resultat_donnee(conf["non_sauve"]["calculextradata_age"], r, typedonnee, message, liste_err) + debug("calcul de la donnée extrapolée : "+texte, liste_err) + if texte!="": + liste_extracalculs.append(texte) print(liste_extracalculs) + # Ajouter le trait ? + if conf["non_sauve"]["calculextradata_trace"] == "oui": + dessine_guides(conf["non_sauve"]["calculextradata_age"], r, conf["couleurs"]["cadretxt"], unite, ax, liste_err) - # Calculer un âge où on atteint cette donnée + ### Calculer un âge où on atteint cette donnée if conf["non_sauve"]["calculextratemps_type"] == typedonnee: - r = calcule_age_extrapole(dates_extrapole, donnees_extrapole, conf["non_sauve"]["calculextratemps_val"], typedonnee, liste_err) - if r!="": - liste_extracalculs.append(r) + # interpolation + r = interpole_lineaire_ordonnee(l_jours,l_poids,conf["non_sauve"]["calculextratemps_val"], liste_err) + if r==-1: + # ça sera donc une extrapolation + r = calcule_age_extrapole(dates_extrapole, donnees_extrapole, conf["non_sauve"]["calculextratemps_val"], liste_err) + message=formate_extrapole(conf["non_sauve"]["nbextradata"]) + else: + message=formate_interpole() + + texte = formate_resultat_age(r, conf["non_sauve"]["calculextratemps_val"], typedonnee, message, liste_err) + + #r = calcule_age_extrapole(dates_extrapole, donnees_extrapole, conf["non_sauve"]["calculextratemps_val"], typedonnee, liste_err) + if texte!="": + liste_extracalculs.append(texte) print(liste_extracalculs) + # Ajouter le trait ? + if conf["non_sauve"]["calculextratemps_trace"]: + dessine_guides(r, conf["non_sauve"]["calculextratemps_val"], conf["couleurs"]["cadretxt"], unite, ax, liste_err) except: warning("Des problèmes pour extrapoler...", liste_err) @@ -246,6 +309,23 @@ def cree_figure(conf,l_jours,l_poids,typedonnee,liste_extracalculs, liste_err): poids_max = poids_max * 1.05 + ### Repères additionnels éventuels. + #reperes est une liste qui contient des dictionnaires avec "typed" (type de donnée : âge, etc), "donnee" : + #la donnée (en jours pour l'âge), et "texte": le texte à mettre sur le repère en question. + #Pour tracer des repères verticaux (horizontaux plus tard) sur la courbe. + for rep in conf["liste_reperes"]: + if rep.get("trace", "") == "oui": # SI on veut tracer + agec = u.convertitunite(rep["donnee"], unite, liste_err) + # Tracé de la ligne verticale + ax.vlines(agec, poids_min, poids_max, linestyles="dashed", color=conf["couleurs"]["cadretxt"]) + # Tracé éventuel du texte + if rep["texte"] != "": + ax.text(agec, poids_min, " "+rep["texte"], rotation=90, verticalalignment='bottom', horizontalalignment='right', color=conf["couleurs"]["cadretxt"]) + + + + + # Grille custom ? if conf["non_sauve"]["grilleamelio"] == "oui": debug("On a choisi la grille plus jolie", liste_err) @@ -371,4 +451,14 @@ def prolongecourbe(tableauOMS, dates, donnees, typecourbe, liste_err): ligne2 = tableauOMS[int(j)] nouvdonnees.append(coeff_moyen*ligne2[imin]+ (1-coeff_moyen)*ligne2[imax]) - return nouvdates,nouvdonnees \ No newline at end of file + return nouvdates,nouvdonnees + + +def dessine_guides(t, data, couleur, unite, ax, liste_err): + """ dessine deux lignes, horizontales et verticales qui vont "vers" la courbe + jusqu'aux points (t, data). En pointillés et avec un point dessus.""" + debug("Début de dessine_guides"+str(t)+", "+str(data), liste_err) + t_conv = u.convertitunite(t,unite,liste_err) + ax.vlines(t_conv, 0, data, colors=couleur, linestyles="dashed") + ax.hlines(data, 0, t_conv, color=couleur, linestyles="dashed") + ax.plot([t_conv], [data], color=couleur, marker="*", ms=13)