Possibilité de prolonger la courbe

[perso/Denise/oms.git] / trace_courbe.py

diff --git a/trace_courbe.py b/trace_courbe.py
index d004dcb7b485cbfc9ccf3298e452c82278d069a3..fab64718c0f7508795f13fea2854b268e5b3d19e 100644 (file)
--- a/trace_courbe.py
+++ b/trace_courbe.py
@@ -51,15 +51,13 @@ def cree_figure(conf,l_jours,l_poids,typedonnee,liste_err):
     # à toutes les données.
     # Si agecorrige est non, alors on veut ajouter la valeur de préma aux courbes de référence.
 
     # à toutes les données.
     # Si agecorrige est non, alors on veut ajouter la valeur de préma aux courbes de référence.
 

-    debug("Prématurité : "+str(prema)+"age corrigé : "+conf["agecorrige"],liste_err)
-
+    debug("Prématurité : "+str(prema)+" age corrigé : "+conf["agecorrige"],liste_err)

             
     if prema>0 and conf["agecorrige"] == "oui":
         l_jours = [j-prema for j in l_jours]
         jour_maxi = jour_maxi - prema
 #        debug("liste des jours : "+str(l_jours),liste_err)
             
     if prema>0 and conf["agecorrige"] == "oui":
         l_jours = [j-prema for j in l_jours]
         jour_maxi = jour_maxi - prema
 #        debug("liste des jours : "+str(l_jours),liste_err)

-    else:
-        debug("bla",liste_err)
+

     l_jours_conv = convertit_tableau(l_jours,unite,liste_err)
     # Attention, comme les jours commencent à partir de 0, faut enlever 1 pour avoir la borne...
     age_maxi = convertitunite(jour_maxi-1,unite,liste_err)
     l_jours_conv = convertit_tableau(l_jours,unite,liste_err)
     # Attention, comme les jours commencent à partir de 0, faut enlever 1 pour avoir la borne...
     age_maxi = convertitunite(jour_maxi-1,unite,liste_err)


@@ -113,7 +111,7 @@ def cree_figure(conf,l_jours,l_poids,typedonnee,liste_err):
         
     
     # convertir les unités
         
     
     # convertir les unités

-    
+    #### Partie code OMS

     #### On extrait les données des courbes, et on convertit les jours dans l'unité voulues
     try:
         t = lire_fichier_csv(fichier_oms)
     #### On extrait les données des courbes, et on convertit les jours dans l'unité voulues
     try:
         t = lire_fichier_csv(fichier_oms)


@@ -142,13 +140,16 @@ def cree_figure(conf,l_jours,l_poids,typedonnee,liste_err):
     plt.rcParams['grid.color'] = conf["couleurs"]["grille"]
     plt.rcParams['legend.edgecolor'] = conf["couleurs"]["grille"]
 
     plt.rcParams['grid.color'] = conf["couleurs"]["grille"]
     plt.rcParams['legend.edgecolor'] = conf["couleurs"]["grille"]
 

-    #warning("bla"+str(liste_data_labels),liste_err)  
+    #Tracé des courbes OMS

     for (i,label,couleur) in liste_data_labels:
         plt.plot(coljour,extraire_colonne(t,i,jour_maxi),label=label,color=couleur)
         #warning("colonne"+str(i)+str(label)+str(couleur),liste_err)
 
     debug("cree_figure : tracé des courbes OMS ok",liste_err) 
     
     for (i,label,couleur) in liste_data_labels:
         plt.plot(coljour,extraire_colonne(t,i,jour_maxi),label=label,color=couleur)
         #warning("colonne"+str(i)+str(label)+str(couleur),liste_err)
 
     debug("cree_figure : tracé des courbes OMS ok",liste_err) 
     

+    
+    ##### Tracé des courbes OMS fini
+    

     # On extrait la valeur min et la valeur max des poids
     (colonne_min,_,_) = liste_data_labels[-1]
     (colonne_max,_,_) = liste_data_labels[0]
     # On extrait la valeur min et la valeur max des poids
     (colonne_min,_,_) = liste_data_labels[-1]
     (colonne_max,_,_) = liste_data_labels[0]


@@ -165,20 +166,43 @@ def cree_figure(conf,l_jours,l_poids,typedonnee,liste_err):
     poids_min = max(0,poids_min-1)
     #max : +5% 
     poids_max = poids_max * 1.05
     poids_min = max(0,poids_min-1)
     #max : +5% 
     poids_max = poids_max * 1.05

+        

     
     

-    #warning("Jusque là ça marche",liste_err)

     debug("cree_figure : prête à tracer la courbe de l'enfant",liste_err)
 
     debug("cree_figure : prête à tracer la courbe de l'enfant",liste_err)
 

-

     ### Tracé pour de bon    
     if l_jours != []:
         plt.plot(l_jours_conv,l_poids,label=conf["nom"],color=conf["couleurs"]["cadretxt"],marker='o')
         debug("Tracé de la courbe enfant, avec les jours "+str(l_jours_conv),liste_err)
     ### Tracé pour de bon    
     if l_jours != []:
         plt.plot(l_jours_conv,l_poids,label=conf["nom"],color=conf["couleurs"]["cadretxt"],marker='o')
         debug("Tracé de la courbe enfant, avec les jours "+str(l_jours_conv),liste_err)

-    
+        
+        #### extrapolatios éventuelles
+        #print("prolongercourbes" in conf)
+        if conf["prolongercourbes"] == "oui":
+            #print("coucou")
+            # les dates, on prend tous les jours tant qu'à faire
+            date_fin = int(l_jours[-1])
+            dates_extrapole = list(range(date_fin, jour_maxi))
+            donnees_extrapole =  prolongecourbe(t, date_fin, l_poids[-1], dates_extrapole, conf["typecourbe"], liste_err)
+            #print("données extrapolées !")
+            dates_extrapole = convertit_tableau(dates_extrapole,unite,liste_err)
+            
+            # tracé des données extrapolées
+            plt.plot(dates_extrapole, donnees_extrapole,color=conf["couleurs"]["cadretxt"], linestyle=(0, (5,7)), marker=None)
+        
+    else:
+        debug("On ne trace pas de courbe enfant", liste_err)
+

     plt.xlabel("Âge en "+unite,color=conf["couleurs"]["cadretxt"])
     plt.ylabel(typedonnee.capitalize()+" en "+CONFIG["unites_typedonnees"][typedonnee],color=conf["couleurs"]["cadretxt"])
     plt.xlabel("Âge en "+unite,color=conf["couleurs"]["cadretxt"])
     plt.ylabel(typedonnee.capitalize()+" en "+CONFIG["unites_typedonnees"][typedonnee],color=conf["couleurs"]["cadretxt"])

+    #print("bla")

     plt.title(titre,color=conf["couleurs"]["cadretxt"])
     plt.title(titre,color=conf["couleurs"]["cadretxt"])

-    plt.axis([min(0,l_jours_conv[0]),age_maxi,poids_min,poids_max])
+    #print("ble")
+    if l_jours_conv == []:
+        plt.axis([0,age_maxi, poids_min, poids_max])
+    else:
+        plt.axis([min(0,l_jours_conv[0]),age_maxi,poids_min,poids_max])
+    #print("bli")
+

     
     if conf['legende']=="oui":
         legende = plt.legend(loc=conf['positionlegende'])
     
     if conf['legende']=="oui":
         legende = plt.legend(loc=conf['positionlegende'])


@@ -187,5 +211,50 @@ def cree_figure(conf,l_jours,l_poids,typedonnee,liste_err):
 
     fig.tight_layout()
     
 
     fig.tight_layout()
     

-    #warning("Jusque là ça marche",liste_err)
-    return fig
\ No newline at end of file
+    debug("Fin de cree_figure", liste_err)
+    return fig
+
+
+
+def prolongecourbe(tableauOMS, date, donnee, nouvdates, typecourbe, liste_err):
+    """ tableauOMS est le ableau des données OMS. date et donnee sont la date (jours)
+    et la dernière donnée d'où on extrapole. On veut les extrapolations à nouvdate 
+    (tableaux de jours)
+    typecourbe est P ou Z. Pour P il faut commencer à regarder à l'indice 4, pour Z
+    à l'indice 1
+    On renvoie [] si pas pu extrapoler. """
+    
+    # la ligne OMS
+    ligneoms = tableauOMS[date]
+    debug("prolongecourbe : Ligne OMS :"+str(ligneoms)+" valeur de donnée : "+str(donnee), liste_err)
+    
+    
+    # On cherche dans quel intervalle on se situe
+    if typecourbe == "P":
+        idep=4
+    else:
+        idep = 1
+    i = idep
+    while i<len(ligneoms) and ligneoms[i]<donnee:
+        i+=1
+    debug("prolongecourbe : on a trouvé la valeur de i : "+str(i),liste_err)
+    if i>=len(ligneoms):
+        warning("prolongation de courbe : pas réussi... donnée au dessus !", liste_err)
+        return []
+    if i==idep:
+        warning("prolongation de courbe : pas réussi... donnée en dessous !", liste_err)
+        return []
+    
+    # Le coeff : donnee = coeff * l[i-1]+ (1-coeff)*ligne[i]
+    # On utilisera la même chose pour la nouvelle donnee
+    #print(ligneoms[i], ligneoms[i-1])
+    coeff = (donnee - ligneoms[i])/(ligneoms[i-1] - ligneoms[i])
+    #print("coeff : "+str(coeff))
+    
+    # extrapolations
+    nouvdonnees = []
+    for j in nouvdates:
+        ligne2 = tableauOMS[j]
+        nouvdonnees.append(coeff*ligne2[i-1]+ (1-coeff)*ligne2[i])
+
+    return nouvdonnees
\ No newline at end of file