trace_courbe.py

   1 #!/usr/bin/env python3
   2 # -*- coding: utf-8 -*-
   3 from configuration import CONFIG
   4 from gestionOMS import *
   5 from gestion_unites import *
   6 from gestion_donnees import calcule_max_graphique, convertit_jours_vers_python
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   8 import matplotlib.pyplot as plt
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  10 # Essentiellement, la fonction qui trace la courbe
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  13 def cree_figure(conf,l_jours,l_poids,typedonnee,liste_err):
  14     debug("debut de cree_figure",liste_err)
  15     try:
  16         liste_data_labels_p,liste_data_labels_z = renvoie_liste_labels(conf,CONFIG["liste_data_choisie_p"],CONFIG["liste_data_choisie_z"],liste_err)
  17     except:
  18         erreur("bug avec liste data labels",liste_err)
  19         return ""
  20
  21     # maxi saisi par l'utilisateur ?
  22     if conf["maxi"] ==0:
  23         # Est-ce qu'on a donné un maxi quand même (car même échelle) ?
  24         print(conf)
  25         print(conf["non_sauve"])
  26         if conf["non_sauve"].get("maxi",0) == 0:
  27             jour_maxi = calcule_max_graphique(l_jours)
  28         else:
  29             jour_maxi = conf["non_sauve"]["maxi"]+1
  30     else:
  31         jour_maxi = conf["maxi"]+1
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  34     # On s'assure que c'est bien compris dans les bornes
  35     jour_maxi = max(CONFIG["jours_mini_courbe"],min(jour_maxi,CONFIG["jours_maxi_courbe"]))
  36     debug("cree_figure : gestion du jour max ok : "+str(jour_maxi),liste_err)
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  38     # si l'unité n'est pas précisée, ni en "non sauvé" ni par l'utilisateur
  39     if conf["unite"] == "" and conf["non_sauve"].get("unite","") == "":
  40         unite = choix_unite(jour_maxi)
  41         debug("Unité non précisée, on choisit "+unite,liste_err)
  42     elif conf["unite"] != "":
  43         unite = conf["unite"]
  44     else:
  45         unite = conf["non_sauve"]["unite"]
  46
  47     #debug("prématurité dans la config : "+conf["prematurite"],liste_err)
  48     prema = int(convertit_jours_vers_python(conf["prematurite"],liste_err))
  49     ## Gestion des prémas, deux cas :
  50     # Si agecorrige est oui, alors on veut juste soustraire la valeur de préma
  51     # à toutes les données.
  52     # Si agecorrige est non, alors on veut ajouter la valeur de préma aux courbes de référence.
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  54     debug("Prématurité : "+str(prema)+"age corrigé : "+conf["agecorrige"],liste_err)
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  57     if prema>0 and conf["agecorrige"] == "oui":
  58         l_jours = [j-prema for j in l_jours]
  59         jour_maxi = jour_maxi - prema
  60 #        debug("liste des jours : "+str(l_jours),liste_err)
  61     else:
  62         debug("bla",liste_err)
  63     l_jours_conv = convertit_tableau(l_jours,unite,liste_err)
  64     # Attention, comme les jours commencent à partir de 0, faut enlever 1 pour avoir la borne...
  65     age_maxi = convertitunite(jour_maxi-1,unite,liste_err)
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  67     debug("cree_figure : conversion des unités ok : "+str(l_jours_conv),liste_err)
  68
  69     titre = "Courbe de "+typedonnee+" OMS"
  70
  71     if conf["typecourbe"] == "P":
  72         # percentiles
  73         liste_data_labels = liste_data_labels_p
  74         if conf["sexe"] == "M":
  75             fichier_oms = CONFIG["fichiersOMS"][typedonnee]["perc_garcon"]#f_poids_perc_garcon
  76             titre  += " (percentiles, garçon)"
  77         elif conf["sexe"] == "F":
  78             fichier_oms = CONFIG["fichiersOMS"][typedonnee]["perc_fille"]
  79             titre += " (percentiles, fille)"
  80         else:
  81             fichier_oms = CONFIG["fichiersOMS"][typedonnee]["perc_mixte"]
  82             titre += " (percentiles)"
  83     elif conf["typecourbe"] == "Z":
  84         liste_data_labels = liste_data_labels_z
  85         if conf["sexe"] == "M":
  86             fichier_oms = CONFIG["fichiersOMS"][typedonnee]["z_garcon"]
  87             titre += " (moyenne et écarts-types, garçon)"
  88         elif conf["sexe"] == "F":
  89             fichier_oms = CONFIG["fichiersOMS"][typedonnee]["z_fille"]
  90             titre += " (moyenne et écarts-types, fille)"
  91         else:
  92             fichier_oms = CONFIG["fichiersOMS"][typedonnee]["z_mixte"]
  93             titre += " (moyenne et écarts-types)"
  94     else:
  95         erreur("Type de courbe invalide"+conf["typecourbe"],liste_err)
  96         return ""
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  98     # Si y'a un nom on met "courbe de machin"
  99     if conf["nom"] !="":
 100         titre += " de " +conf["nom"]
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 103     if prema>0:
 104         titre+= ", préma de "+conf["prematurite"]
 105         if conf["agecorrige"] == "oui":
 106             titre+=" (courbe en âge corrigé)"
 107         else:
 108             titre+=" (courbe en âge réel, données OMS décalées)"
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 110     debug("cree_figure : géré le type de courbe ok. Liste des data labels : "+str(liste_data_labels),liste_err)
 111     debug("Fichier d'où extraire les données : "+fichier_oms,liste_err)
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 115     # convertir les unités
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 117     #### On extrait les données des courbes, et on convertit les jours dans l'unité voulues
 118     try:
 119         t = lire_fichier_csv(fichier_oms)
 120     except:
 121         liste_err[0].append("Impossible d'ouvrir le fichier "+fichier_oms)
 122         return ""
 123
 124     debug("cree_figure : on va convertir données OMS à la bonne unité",liste_err)
 125     try:
 126         coljour= (extraire_colonne(t,0,jour_maxi))
 127         if prema>0 and conf["agecorrige"] != "oui":
 128             coljour = [j + prema for j in coljour]
 129         coljour = convertit_tableau(coljour,unite,liste_err)
 130     except:
 131         erreur("Problème à la conversion du tableau OMS. jour_maxi = "+str(jour_maxi)+" unite = "+unite,liste_err)
 132         return ""
 133
 134     debug("cree_figure : prête à créer la figure",liste_err)
 135     #### La figure, params
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 137     fig = plt.figure(num=None, figsize=(conf["largeur"], conf["hauteur"]), dpi=100, facecolor=conf["couleurs"]["fond"])
 138     plt.rcParams['axes.facecolor'] = conf["couleurs"]["fond"]
 139     plt.rcParams['axes.edgecolor']= conf["couleurs"]["cadretxt"]
 140     plt.rcParams['xtick.color'] = conf["couleurs"]["cadretxt"]
 141     plt.rcParams['ytick.color'] = conf["couleurs"]["cadretxt"]
 142     plt.rcParams['grid.color'] = conf["couleurs"]["grille"]
 143     plt.rcParams['legend.edgecolor'] = conf["couleurs"]["grille"]
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 145     #warning("bla"+str(liste_data_labels),liste_err)
 146     for (i,label,couleur) in liste_data_labels:
 147         plt.plot(coljour,extraire_colonne(t,i,jour_maxi),label=label,color=couleur)
 148         #warning("colonne"+str(i)+str(label)+str(couleur),liste_err)
 149
 150     debug("cree_figure : tracé des courbes OMS ok",liste_err)
 151
 152     # On extrait la valeur min et la valeur max des poids
 153     (colonne_min,_,_) = liste_data_labels[-1]
 154     (colonne_max,_,_) = liste_data_labels[0]
 155
 156     debug("cree_figure : colonnes min et max : "+str(colonne_min)+" "+str(colonne_max),liste_err)
 157
 158     poids_min = min(extraire_colonne(t,colonne_min,jour_maxi))
 159     poids_max = max(extraire_colonne(t,colonne_max,jour_maxi))
 160     if l_jours != []:
 161         poids_min = min(min(l_poids),poids_min)
 162         poids_max = max(max(l_poids),poids_max)
 163     # On ajuste un peu ces min et max
 164     # min : valeur min -1kg
 165     poids_min = max(0,poids_min-1)
 166     #max : +5%
 167     poids_max = poids_max * 1.05
 168
 169     #warning("Jusque là ça marche",liste_err)
 170     debug("cree_figure : prête à tracer la courbe de l'enfant",liste_err)
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 173     ### Tracé pour de bon
 174     if l_jours != []:
 175         plt.plot(l_jours_conv,l_poids,label=conf["nom"],color=conf["couleurs"]["cadretxt"],marker='o')
 176         debug("Tracé de la courbe enfant, avec les jours "+str(l_jours_conv),liste_err)
 177
 178     plt.xlabel("Âge en "+unite,color=conf["couleurs"]["cadretxt"])
 179     plt.ylabel(typedonnee.capitalize()+" en "+CONFIG["unites_typedonnees"][typedonnee],color=conf["couleurs"]["cadretxt"])
 180     plt.title(titre,color=conf["couleurs"]["cadretxt"])
 181     plt.axis([min(0,l_jours_conv[0]),age_maxi,poids_min,poids_max])
 182
 183     if conf['legende']=="oui":
 184         legende = plt.legend(loc=conf['positionlegende'])
 185         plt.setp(legende.get_texts(), color=conf["couleurs"]["cadretxt"])
 186     plt.grid(conf["grille"]=="oui")
 187
 188     fig.tight_layout()
 189
 190     #warning("Jusque là ça marche",liste_err)
 191     return fig