]>
Commit | Line | Data |
---|---|---|
5679dfd0 DL |
1 | #!/usr/bin/env python3 |
2 | # -*- coding: utf-8 -*- | |
d03279e7 | 3 | from configuration import CONFIG |
5679dfd0 DL |
4 | from gestionOMS import * |
5 | from gestion_unites import * | |
b5ac625b | 6 | from gestion_donnees import calcule_max_graphique, convertit_jours_vers_python |
fd69b6b5 | 7 | |
5679dfd0 DL |
8 | import matplotlib.pyplot as plt |
9 | ||
d03279e7 DL |
10 | # Essentiellement, la fonction qui trace la courbe |
11 | ||
12 | ||
8b5845ff | 13 | def cree_figure(conf,l_jours,l_poids,typedonnee,liste_err): |
248d9504 | 14 | debug("debut de cree_figure",liste_err) |
fd69b6b5 | 15 | try: |
d03279e7 | 16 | liste_data_labels_p,liste_data_labels_z = renvoie_liste_labels(conf,CONFIG["liste_data_choisie_p"],CONFIG["liste_data_choisie_z"],liste_err) |
fd69b6b5 DL |
17 | except: |
18 | erreur("bug avec liste data labels",liste_err) | |
19 | return "" | |
20 | ||
8b5845ff | 21 | # maxi saisi par l'utilisateur ? |
fd69b6b5 | 22 | if conf["maxi"] ==0: |
8b5845ff DL |
23 | # Est-ce qu'on a donné un maxi quand même (car même échelle) ? |
24 | print(conf) | |
25 | print(conf["non_sauve"]) | |
26 | if conf["non_sauve"].get("maxi",0) == 0: | |
8b5845ff | 27 | jour_maxi = calcule_max_graphique(l_jours) |
5679dfd0 | 28 | else: |
8b5845ff | 29 | jour_maxi = conf["non_sauve"]["maxi"]+1 |
5679dfd0 DL |
30 | else: |
31 | jour_maxi = conf["maxi"]+1 | |
248d9504 DL |
32 | |
33 | ||
9e4c51c7 | 34 | # On s'assure que c'est bien compris dans les bornes |
9e4c51c7 | 35 | jour_maxi = max(CONFIG["jours_mini_courbe"],min(jour_maxi,CONFIG["jours_maxi_courbe"])) |
248d9504 | 36 | debug("cree_figure : gestion du jour max ok : "+str(jour_maxi),liste_err) |
5679dfd0 | 37 | |
8b5845ff DL |
38 | # si l'unité n'est pas précisée, ni en "non sauvé" ni par l'utilisateur |
39 | if conf["unite"] == "" and conf["non_sauve"].get("unite","") == "": | |
40 | unite = choix_unite(jour_maxi) | |
41 | debug("Unité non précisée, on choisit "+unite,liste_err) | |
42 | elif conf["unite"] != "": | |
43 | unite = conf["unite"] | |
44 | else: | |
45 | unite = conf["non_sauve"]["unite"] | |
46 | ||
b5ac625b DL |
47 | #debug("prématurité dans la config : "+conf["prematurite"],liste_err) |
48 | prema = int(convertit_jours_vers_python(conf["prematurite"],liste_err)) | |
49 | ## Gestion des prémas, deux cas : | |
50 | # Si agecorrige est oui, alors on veut juste soustraire la valeur de préma | |
51 | # à toutes les données. | |
52 | # Si agecorrige est non, alors on veut ajouter la valeur de préma aux courbes de référence. | |
53 | ||
54 | debug("Prématurité : "+str(prema)+"age corrigé : "+conf["agecorrige"],liste_err) | |
55 | ||
56 | ||
57 | if prema>0 and conf["agecorrige"] == "oui": | |
58 | l_jours = [j-prema for j in l_jours] | |
59 | jour_maxi = jour_maxi - prema | |
60 | # debug("liste des jours : "+str(l_jours),liste_err) | |
61 | else: | |
62 | debug("bla",liste_err) | |
8b5845ff | 63 | l_jours_conv = convertit_tableau(l_jours,unite,liste_err) |
5679dfd0 | 64 | # Attention, comme les jours commencent à partir de 0, faut enlever 1 pour avoir la borne... |
8b5845ff | 65 | age_maxi = convertitunite(jour_maxi-1,unite,liste_err) |
5679dfd0 | 66 | |
b5ac625b | 67 | debug("cree_figure : conversion des unités ok : "+str(l_jours_conv),liste_err) |
fd69b6b5 | 68 | |
8b5845ff | 69 | titre = "Courbe de "+typedonnee+" OMS" |
5679dfd0 DL |
70 | |
71 | if conf["typecourbe"] == "P": | |
72 | # percentiles | |
73 | liste_data_labels = liste_data_labels_p | |
74 | if conf["sexe"] == "M": | |
8b5845ff | 75 | fichier_oms = CONFIG["fichiersOMS"][typedonnee]["perc_garcon"]#f_poids_perc_garcon |
5679dfd0 | 76 | titre += " (percentiles, garçon)" |
a46e1269 | 77 | elif conf["sexe"] == "F": |
8b5845ff | 78 | fichier_oms = CONFIG["fichiersOMS"][typedonnee]["perc_fille"] |
5679dfd0 | 79 | titre += " (percentiles, fille)" |
a46e1269 | 80 | else: |
8b5845ff | 81 | fichier_oms = CONFIG["fichiersOMS"][typedonnee]["perc_mixte"] |
a46e1269 | 82 | titre += " (percentiles)" |
5679dfd0 DL |
83 | elif conf["typecourbe"] == "Z": |
84 | liste_data_labels = liste_data_labels_z | |
d03279e7 | 85 | if conf["sexe"] == "M": |
8b5845ff | 86 | fichier_oms = CONFIG["fichiersOMS"][typedonnee]["z_garcon"] |
5679dfd0 | 87 | titre += " (moyenne et écarts-types, garçon)" |
a46e1269 | 88 | elif conf["sexe"] == "F": |
8b5845ff | 89 | fichier_oms = CONFIG["fichiersOMS"][typedonnee]["z_fille"] |
5679dfd0 | 90 | titre += " (moyenne et écarts-types, fille)" |
a46e1269 | 91 | else: |
8b5845ff | 92 | fichier_oms = CONFIG["fichiersOMS"][typedonnee]["z_mixte"] |
a46e1269 | 93 | titre += " (moyenne et écarts-types)" |
fd69b6b5 | 94 | else: |
248d9504 DL |
95 | erreur("Type de courbe invalide"+conf["typecourbe"],liste_err) |
96 | return "" | |
248d9504 | 97 | |
5679dfd0 DL |
98 | # Si y'a un nom on met "courbe de machin" |
99 | if conf["nom"] !="": | |
100 | titre += " de " +conf["nom"] | |
b5ac625b DL |
101 | |
102 | ||
103 | if prema>0: | |
104 | titre+= ", préma de "+conf["prematurite"] | |
105 | if conf["agecorrige"] == "oui": | |
106 | titre+=" (courbe en âge corrigé)" | |
107 | else: | |
108 | titre+=" (courbe en âge réel, données OMS décalées)" | |
109 | ||
110 | debug("cree_figure : géré le type de courbe ok. Liste des data labels : "+str(liste_data_labels),liste_err) | |
111 | debug("Fichier d'où extraire les données : "+fichier_oms,liste_err) | |
112 | ||
5679dfd0 DL |
113 | |
114 | ||
115 | # convertir les unités | |
116 | ||
117 | #### On extrait les données des courbes, et on convertit les jours dans l'unité voulues | |
a46e1269 DL |
118 | try: |
119 | t = lire_fichier_csv(fichier_oms) | |
120 | except: | |
121 | liste_err[0].append("Impossible d'ouvrir le fichier "+fichier_oms) | |
248d9504 | 122 | return "" |
5679dfd0 | 123 | |
248d9504 | 124 | debug("cree_figure : on va convertir données OMS à la bonne unité",liste_err) |
b5ac625b DL |
125 | try: |
126 | coljour= (extraire_colonne(t,0,jour_maxi)) | |
127 | if prema>0 and conf["agecorrige"] != "oui": | |
128 | coljour = [j + prema for j in coljour] | |
129 | coljour = convertit_tableau(coljour,unite,liste_err) | |
248d9504 DL |
130 | except: |
131 | erreur("Problème à la conversion du tableau OMS. jour_maxi = "+str(jour_maxi)+" unite = "+unite,liste_err) | |
132 | return "" | |
133 | ||
134 | debug("cree_figure : prête à créer la figure",liste_err) | |
b5ac625b DL |
135 | #### La figure, params |
136 | ||
915e90bb DL |
137 | fig = plt.figure(num=None, figsize=(conf["largeur"], conf["hauteur"]), dpi=100, facecolor=conf["couleurs"]["fond"]) |
138 | plt.rcParams['axes.facecolor'] = conf["couleurs"]["fond"] | |
139 | plt.rcParams['axes.edgecolor']= conf["couleurs"]["cadretxt"] | |
140 | plt.rcParams['xtick.color'] = conf["couleurs"]["cadretxt"] | |
141 | plt.rcParams['ytick.color'] = conf["couleurs"]["cadretxt"] | |
142 | plt.rcParams['grid.color'] = conf["couleurs"]["grille"] | |
143 | plt.rcParams['legend.edgecolor'] = conf["couleurs"]["grille"] | |
fd69b6b5 DL |
144 | |
145 | #warning("bla"+str(liste_data_labels),liste_err) | |
5679dfd0 DL |
146 | for (i,label,couleur) in liste_data_labels: |
147 | plt.plot(coljour,extraire_colonne(t,i,jour_maxi),label=label,color=couleur) | |
fd69b6b5 DL |
148 | #warning("colonne"+str(i)+str(label)+str(couleur),liste_err) |
149 | ||
248d9504 | 150 | debug("cree_figure : tracé des courbes OMS ok",liste_err) |
5679dfd0 DL |
151 | |
152 | # On extrait la valeur min et la valeur max des poids | |
fd69b6b5 DL |
153 | (colonne_min,_,_) = liste_data_labels[-1] |
154 | (colonne_max,_,_) = liste_data_labels[0] | |
5679dfd0 | 155 | |
d03279e7 DL |
156 | debug("cree_figure : colonnes min et max : "+str(colonne_min)+" "+str(colonne_max),liste_err) |
157 | ||
5679dfd0 DL |
158 | poids_min = min(extraire_colonne(t,colonne_min,jour_maxi)) |
159 | poids_max = max(extraire_colonne(t,colonne_max,jour_maxi)) | |
160 | if l_jours != []: | |
161 | poids_min = min(min(l_poids),poids_min) | |
162 | poids_max = max(max(l_poids),poids_max) | |
163 | # On ajuste un peu ces min et max | |
164 | # min : valeur min -1kg | |
165 | poids_min = max(0,poids_min-1) | |
166 | #max : +5% | |
167 | poids_max = poids_max * 1.05 | |
168 | ||
fd69b6b5 | 169 | #warning("Jusque là ça marche",liste_err) |
248d9504 | 170 | debug("cree_figure : prête à tracer la courbe de l'enfant",liste_err) |
b5ac625b DL |
171 | |
172 | ||
173 | ### Tracé pour de bon | |
5679dfd0 | 174 | if l_jours != []: |
248d9504 | 175 | plt.plot(l_jours_conv,l_poids,label=conf["nom"],color=conf["couleurs"]["cadretxt"],marker='o') |
b5ac625b | 176 | debug("Tracé de la courbe enfant, avec les jours "+str(l_jours_conv),liste_err) |
5679dfd0 | 177 | |
8b5845ff DL |
178 | plt.xlabel("Âge en "+unite,color=conf["couleurs"]["cadretxt"]) |
179 | plt.ylabel(typedonnee.capitalize()+" en "+CONFIG["unites_typedonnees"][typedonnee],color=conf["couleurs"]["cadretxt"]) | |
915e90bb | 180 | plt.title(titre,color=conf["couleurs"]["cadretxt"]) |
b5ac625b | 181 | plt.axis([min(0,l_jours_conv[0]),age_maxi,poids_min,poids_max]) |
5679dfd0 DL |
182 | |
183 | if conf['legende']=="oui": | |
fd69b6b5 | 184 | legende = plt.legend(loc=conf['positionlegende']) |
915e90bb | 185 | plt.setp(legende.get_texts(), color=conf["couleurs"]["cadretxt"]) |
5679dfd0 DL |
186 | plt.grid(conf["grille"]=="oui") |
187 | ||
188 | fig.tight_layout() | |
fd69b6b5 DL |
189 | |
190 | #warning("Jusque là ça marche",liste_err) | |
5679dfd0 | 191 | return fig |